84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0192 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 
445 aa  902    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  78.88 
 
 
445 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  77.73 
 
 
442 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  49.21 
 
 
445 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  50.79 
 
 
452 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  49.78 
 
 
451 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  49.78 
 
 
451 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  51.25 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  47.95 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  47.18 
 
 
446 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  46.28 
 
 
446 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  50.45 
 
 
444 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  48.44 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  51.69 
 
 
453 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  49.77 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  50.79 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  47.63 
 
 
445 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  48.53 
 
 
441 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  46.09 
 
 
445 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  50.34 
 
 
461 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  50.79 
 
 
453 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  50.34 
 
 
461 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  47.63 
 
 
452 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  51.45 
 
 
445 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  50.11 
 
 
452 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  46.56 
 
 
454 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  50.11 
 
 
461 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  50.45 
 
 
453 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  49.14 
 
 
445 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  49.55 
 
 
443 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  45.45 
 
 
450 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  47.24 
 
 
458 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  48.87 
 
 
453 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  46.7 
 
 
473 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  45.01 
 
 
450 aa  354  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  45.66 
 
 
450 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  45.5 
 
 
482 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  47.89 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  43.02 
 
 
451 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  47.56 
 
 
466 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  40.94 
 
 
451 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  41.07 
 
 
451 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  35.16 
 
 
590 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  36.26 
 
 
616 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  35.37 
 
 
590 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  33.85 
 
 
600 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  32.61 
 
 
600 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  31.26 
 
 
596 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  31.29 
 
 
612 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  38.27 
 
 
598 aa  216  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.26 
 
 
627 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  38.48 
 
 
607 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  33.7 
 
 
608 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  30.2 
 
 
603 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  38.6 
 
 
619 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  38.76 
 
 
578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  39.43 
 
 
574 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  39.43 
 
 
574 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  39.43 
 
 
574 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  32.44 
 
 
599 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  32.7 
 
 
571 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  38.82 
 
 
561 aa  193  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  34.13 
 
 
575 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  39.3 
 
 
562 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  33.89 
 
 
575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  33.89 
 
 
575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  35.26 
 
 
596 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  37.75 
 
 
588 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  32.14 
 
 
587 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  37.72 
 
 
581 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  35.16 
 
 
570 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  35.03 
 
 
587 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  39.3 
 
 
562 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  37.79 
 
 
594 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  38.02 
 
 
560 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  38.44 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  35.6 
 
 
596 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  34.6 
 
 
578 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  34.01 
 
 
580 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 
654 aa  136  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  30.72 
 
 
587 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  23.53 
 
 
452 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  30.05 
 
 
469 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  24.15 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>