82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4147 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 		 445 aa  898    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  55.78 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  55.66 
 
 		 452 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  54.19 
 
 		 452 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  54.89 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  51.12 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  52.58 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  52.46 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  51.12 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  52.22 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  52.02 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  53.86 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  52.49 
 
 		 451 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  52.49 
 
 		 451 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  54.24 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  53.35 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  54 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  53.35 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  53.02 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  49.89 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  52.11 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  49.89 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  53.35 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  53.12 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  54.24 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  50.66 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  53.5 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  45.96 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  45.74 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  46.09 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  46.12 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  46.12 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  42.54 
 
 		 451 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  43.81 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  43.36 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  46.21 
 
 		 450 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  45.86 
 
 		 482 aa  345  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  43.4 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  43.91 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  43.23 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  44.03 
 
 		 466 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  39.91 
 
 		 449 aa  279  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  35.67 
 
 		 596 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  34.43 
 
 		 590 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  34.2 
 
 		 600 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  34.95 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  33.77 
 
 		 600 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  33.71 
 
 		 612 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  33.48 
 
 		 608 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  34.51 
 
 		 590 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  32.16 
 
 		 603 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  33.85 
 
 		 616 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  33.19 
 
 		 607 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  37.64 
 
 		 619 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  36.15 
 
 		 587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  30.11 
 
 		 599 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  30.26 
 
 		 627 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  34.6 
 
 		 561 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  33.69 
 
 		 562 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  36.09 
 
 		 581 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  31.46 
 
 		 571 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  32.98 
 
 		 570 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  36.96 
 
 		 574 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  36.96 
 
 		 574 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  36.96 
 
 		 574 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 596 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  35.8 
 
 		 584 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  31.88 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  34.97 
 
 		 578 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  31.64 
 
 		 575 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  31.64 
 
 		 575 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  35.42 
 
 		 562 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  35.48 
 
 		 578 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  35.65 
 
 		 588 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  34.36 
 
 		 594 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  31.69 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  32.69 
 
 		 587 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  34.04 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  33.24 
 
 		 580 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 654 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  29.13 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  23.87 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>