More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4526 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  87.76 
 
 
296 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  86.36 
 
 
295 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  86.36 
 
 
295 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  86.01 
 
 
295 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  83.92 
 
 
302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  73.21 
 
 
283 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  73.57 
 
 
280 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  47.1 
 
 
270 aa  285  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  44.96 
 
 
269 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  40.99 
 
 
289 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  39.45 
 
 
267 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  41.01 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  40.74 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  39.43 
 
 
274 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  38.31 
 
 
301 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  36.46 
 
 
273 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  35.4 
 
 
261 aa  208  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  42.08 
 
 
296 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  38.13 
 
 
295 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  42.46 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  35.11 
 
 
315 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0957  putative esterase  34.15 
 
 
265 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  31.73 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.66 
 
 
640 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  30 
 
 
276 aa  118  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1260  putative esterase  30.65 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  34.29 
 
 
279 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0186  putative esterase  29.08 
 
 
265 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3261  putative esterase  38.46 
 
 
199 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  27.03 
 
 
319 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  30.74 
 
 
311 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  30.74 
 
 
317 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  30.74 
 
 
317 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  30.74 
 
 
317 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  31.98 
 
 
307 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  30.18 
 
 
295 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  30.1 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  30.45 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  29.57 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1151  esterase  28.63 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000030129  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  28.79 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  29.96 
 
 
290 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  29.96 
 
 
290 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  29.96 
 
 
281 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  29.96 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  29.96 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  29.96 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  29.96 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  29.96 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  27.19 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  28.21 
 
 
385 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  28.63 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1582  putative esterase  30.74 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  32.56 
 
 
327 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  32.56 
 
 
327 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2890  ATPase  26.67 
 
 
274 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418152  hitchhiker  0.00752314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3478  putative esterase  37.72 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  27.67 
 
 
640 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  29.13 
 
 
456 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2502  putative esterase  28.67 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519739  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  39.74 
 
 
708 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  28.69 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  25.39 
 
 
401 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  26.45 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06770  predicted esterase  30.99 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1371  putative esterase  28.96 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  29.75 
 
 
638 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1557  esterase  30.34 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1185  tributyrin esterase  30.41 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0720  esterase  26.07 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.276052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  31.25 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  24.81 
 
 
560 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1483  esterase  30.65 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  35.91 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2709  putative esterase  25.2 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2653  putative esterase  25.2 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
837 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  28.91 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  33.49 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  35.25 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8816  esterase-like protein  26.55 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144603  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  33.48 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0978  putative esterase  25.36 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  31.87 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1007  putative esterase  25.36 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  27.78 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2723  putative esterase  33.05 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  30.64 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  38.46 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  35.97 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1192  putative esterase  38.64 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.477503  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  24.92 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  34.01 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3320  esterase-like protein  30.71 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494197  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2245  tributyrin esterase EstA, putative  24.21 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  27.63 
 
 
369 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  26.32 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1031  putative esterase  34.9 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>