226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1254 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  100 
 
 
385 aa  796    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  51.74 
 
 
375 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  39.18 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  42.82 
 
 
638 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  40.11 
 
 
369 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  37.53 
 
 
376 aa  249  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  36.41 
 
 
359 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  38.69 
 
 
375 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  38.4 
 
 
640 aa  245  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  36.32 
 
 
388 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  40.11 
 
 
383 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  37.22 
 
 
392 aa  235  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  37.28 
 
 
388 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  36.9 
 
 
392 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  35.13 
 
 
372 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  30.59 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2738  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.87 
 
 
394 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.74 
 
 
388 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1670  putative esterase  30.47 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  37.91 
 
 
560 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  32.04 
 
 
398 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  32.04 
 
 
398 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  32.04 
 
 
389 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  32.35 
 
 
364 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.52 
 
 
389 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  35.41 
 
 
285 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  31.64 
 
 
882 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  32.21 
 
 
286 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  31.25 
 
 
640 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  32.55 
 
 
305 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  32.17 
 
 
490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  30.6 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 
837 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  32.4 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  29.01 
 
 
314 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  28.67 
 
 
314 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  31.51 
 
 
311 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  30.8 
 
 
317 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  30.8 
 
 
317 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  30.8 
 
 
317 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  31.78 
 
 
307 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  28.25 
 
 
327 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  28.25 
 
 
327 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  30.1 
 
 
276 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  28.9 
 
 
289 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  25.28 
 
 
299 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  28.79 
 
 
282 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  28.79 
 
 
286 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  27.91 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  27.95 
 
 
290 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  27.95 
 
 
290 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1478  putative esterase  28.38 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500131  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  27.95 
 
 
281 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  27.95 
 
 
281 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  27.95 
 
 
281 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  27.95 
 
 
281 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  27.95 
 
 
281 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  27.56 
 
 
281 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  27.55 
 
 
283 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  27.92 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  28.17 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  28.17 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  26.82 
 
 
526 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  27.2 
 
 
526 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  27.38 
 
 
295 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  27.67 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  31.19 
 
 
631 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  27.95 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  27.2 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  27.42 
 
 
295 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  27.78 
 
 
301 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  27.02 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  27.04 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  30 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  25.81 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  25.87 
 
 
708 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  32.19 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  27.95 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5724  putative esterase  33.33 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818383  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3478  putative esterase  37.59 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3836  putative esterase  30.41 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  29.88 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  28.39 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1546  putative esterase  26.92 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828639  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3922  putative esterase  29.82 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.079767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3780  putative esterase  29.82 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 
1077 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  26.94 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  31.25 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  25.32 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3899  putative esterase  30.18 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0419016 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  25.91 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  29.17 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  26.14 
 
 
691 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0425  putative esterase  28.21 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  25.41 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2744  putative esterase  25.51 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0667  putative esterase  28.57 
 
 
320 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0524  putative esterase  25.21 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629135  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  29.86 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>