297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0912 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1077 aa  2240    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 619 aa  335  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  35.93 
 
 		 756 aa  318  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  49.82 
 
 		 691 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  47.12 
 
 		 391 aa  258  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  32.75 
 
 		 1059 aa  241  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  32.75 
 
 		 1059 aa  240  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.82 
 
 		 697 aa  220  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  30.52 
 
 		 1037 aa  210  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  37.82 
 
 		 1478 aa  206  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  30.48 
 
 		 1041 aa  203  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  29.6 
 
 		 1020 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  31.37 
 
 		 689 aa  193  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  33.15 
 
 		 331 aa  189  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  35.86 
 
 		 535 aa  184  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  37.11 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  35.03 
 
 		 520 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.51 
 
 		 1019 aa  180  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  35.04 
 
 		 321 aa  178  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  28.52 
 
 		 1018 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  32.61 
 
 		 366 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  27.84 
 
 		 1780 aa  162  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  29.43 
 
 		 423 aa  159  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  32.78 
 
 		 338 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.87 
 
 		 337 aa  155  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  34.98 
 
 		 815 aa  154  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.13 
 
 		 407 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  32.49 
 
 		 323 aa  148  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  33.52 
 
 		 474 aa  146  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 333 aa  146  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 495 aa  146  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  32.84 
 
 		 324 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  28.42 
 
 		 374 aa  145  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.41 
 
 		 1146 aa  145  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  34.46 
 
 		 1001 aa  145  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  33.24 
 
 		 497 aa  144  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  30.41 
 
 		 371 aa  144  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  26.35 
 
 		 690 aa  144  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.51 
 
 		 1495 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  31.87 
 
 		 359 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  25.71 
 
 		 1050 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 837 aa  142  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  33.23 
 
 		 820 aa  141  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  30.11 
 
 		 451 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.07 
 
 		 1331 aa  140  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  28.47 
 
 		 806 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  33.14 
 
 		 474 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  33.33 
 
 		 491 aa  138  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  26.02 
 
 		 912 aa  137  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  33.63 
 
 		 457 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  33.24 
 
 		 472 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  32.4 
 
 		 678 aa  134  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  34.93 
 
 		 756 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  29.1 
 
 		 370 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  32.94 
 
 		 829 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  31.28 
 
 		 423 aa  132  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  32.1 
 
 		 503 aa  131  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  30.05 
 
 		 457 aa  131  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  30.79 
 
 		 477 aa  129  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.87 
 
 		 454 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  27.44 
 
 		 2457 aa  127  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.25 
 
 		 490 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  27.03 
 
 		 1242 aa  126  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  25.54 
 
 		 328 aa  125  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  29.66 
 
 		 347 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  26.47 
 
 		 1215 aa  122  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  29.57 
 
 		 488 aa  120  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  29.36 
 
 		 347 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  29.31 
 
 		 487 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.89 
 
 		 370 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  29.89 
 
 		 451 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  26.84 
 
 		 369 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  29.79 
 
 		 778 aa  115  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  29.78 
 
 		 543 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  25.89 
 
 		 373 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  28.16 
 
 		 364 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  26.11 
 
 		 388 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  29.52 
 
 		 317 aa  108  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  26.51 
 
 		 398 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  24.67 
 
 		 382 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  27.04 
 
 		 401 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  25.63 
 
 		 389 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  29.48 
 
 		 309 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  24.57 
 
 		 399 aa  100  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  29.09 
 
 		 463 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  24.81 
 
 		 383 aa  99.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  24.23 
 
 		 394 aa  97.8  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  24.7 
 
 		 376 aa  97.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  31.34 
 
 		 501 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  25.76 
 
 		 770 aa  95.5  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 639 aa  95.1  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  29.5 
 
 		 388 aa  91.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  48.86 
 
 		 710 aa  88.2  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  55.13 
 
 		 707 aa  87  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 		 628 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  46.49 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  50.63 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  49.45 
 
 		 739 aa  84.7  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  26.91 
 
 		 619 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  23.56 
 
 		 373 aa  84  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>