94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2669 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 
535 aa  1107    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  45.7 
 
 
691 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  43.09 
 
 
391 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  35.86 
 
 
1077 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  34.41 
 
 
631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  41.01 
 
 
1041 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  40.88 
 
 
1018 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  38.1 
 
 
1050 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  38.13 
 
 
1059 aa  98.6  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  38.41 
 
 
1059 aa  98.6  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  36.91 
 
 
1495 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  37.04 
 
 
1019 aa  97.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  37.78 
 
 
1020 aa  93.6  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  34.74 
 
 
837 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  33.7 
 
 
501 aa  90.9  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  32.87 
 
 
1037 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  36.43 
 
 
1215 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  26.71 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  30.59 
 
 
2286 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  27.31 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 
1780 aa  78.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  35.67 
 
 
383 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.34 
 
 
1146 aa  76.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  31.05 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  30.94 
 
 
215 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  24.46 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  35.06 
 
 
388 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  28.5 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.74 
 
 
1331 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  26.02 
 
 
638 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  28.65 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  28.5 
 
 
640 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  35.33 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  31.61 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  25.84 
 
 
376 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1079  peptidase  30.11 
 
 
277 aa  65.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  25 
 
 
385 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  32.84 
 
 
299 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2738  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.23 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1670  putative esterase  28.41 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  30.1 
 
 
285 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.7 
 
 
388 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  31.41 
 
 
375 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  25 
 
 
286 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.14 
 
 
1748 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  29.19 
 
 
398 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  27.84 
 
 
394 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  26.22 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  29.19 
 
 
398 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  29.19 
 
 
364 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  24.75 
 
 
1242 aa  57.4  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  29.19 
 
 
389 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  25.56 
 
 
369 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.19 
 
 
389 aa  57  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  23.96 
 
 
392 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  23.16 
 
 
882 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  34.55 
 
 
1160 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  30.99 
 
 
1418 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  28.68 
 
 
276 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  28.78 
 
 
369 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  28.46 
 
 
327 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  28.46 
 
 
327 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  27.61 
 
 
314 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  28.67 
 
 
281 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  28.67 
 
 
281 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  28.67 
 
 
281 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  28.67 
 
 
281 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  28.67 
 
 
281 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  27.61 
 
 
311 aa  50.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  27.61 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  27.61 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  31.62 
 
 
315 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  27.06 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  28.67 
 
 
290 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  28.67 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  25.18 
 
 
708 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  24.46 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  27.61 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  26.87 
 
 
314 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  22.08 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  27.61 
 
 
317 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0986  putative esterase  25.79 
 
 
335 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  28 
 
 
281 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  30 
 
 
341 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  23.49 
 
 
640 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  23.24 
 
 
332 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  25.6 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0425  putative esterase  24.64 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  26.09 
 
 
341 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  28.92 
 
 
312 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  25.49 
 
 
448 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  26.03 
 
 
295 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0954  putative esterase  23.49 
 
 
346 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06770  predicted esterase  24.53 
 
 
312 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>