131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1510 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 520 aa  1058    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  36.8 
 
 		 756 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 1077 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 		 619 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  31.81 
 
 		 1059 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  31.81 
 
 		 1059 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  32.53 
 
 		 1478 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  29.13 
 
 		 689 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  31.29 
 
 		 1041 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  32.2 
 
 		 1037 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  32.35 
 
 		 457 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  33.14 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  32.56 
 
 		 820 aa  143  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.05 
 
 		 697 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  31.2 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  30.88 
 
 		 495 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  31.4 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  30.93 
 
 		 815 aa  137  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  29.72 
 
 		 366 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  29.47 
 
 		 1050 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.86 
 
 		 1495 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  28.82 
 
 		 321 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  31.95 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  30.12 
 
 		 1020 aa  134  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30 
 
 		 1146 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  26.81 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  32.06 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  24.9 
 
 		 806 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  31.58 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  27.66 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  29.69 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  28.05 
 
 		 1018 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  26.9 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 		 1019 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  26.05 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  27.62 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  28.06 
 
 		 359 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  29.53 
 
 		 829 aa  123  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  27.76 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  31.44 
 
 		 1001 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  28.95 
 
 		 1242 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  26.33 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  31.16 
 
 		 756 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  26.98 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  27.46 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.01 
 
 		 370 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.81 
 
 		 1331 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  29.37 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  29.14 
 
 		 778 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  27.64 
 
 		 912 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  27.3 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 		 837 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  28.24 
 
 		 690 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  28.28 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 678 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  27.64 
 
 		 2457 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  26.35 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  30.28 
 
 		 1215 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  27.89 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  27.43 
 
 		 1780 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  25.61 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.65 
 
 		 490 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  27 
 
 		 463 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  26.57 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  25.57 
 
 		 376 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  27.71 
 
 		 488 aa  96.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  23.51 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  27.64 
 
 		 451 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  25.66 
 
 		 389 aa  94.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  26.27 
 
 		 487 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  21.6 
 
 		 347 aa  93.6  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  23.44 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  21.6 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  26.67 
 
 		 375 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  25.93 
 
 		 398 aa  90.1  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 628 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  23.12 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  27.07 
 
 		 619 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  25.87 
 
 		 503 aa  87.8  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  26.1 
 
 		 477 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  24.9 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  26.84 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  24 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  24.91 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  23.05 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  25.52 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  23.68 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  25.26 
 
 		 770 aa  80.1  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  22.86 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  22.32 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  26.17 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  24.61 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  24.74 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  27.01 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  25.47 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  23.1 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  25.82 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>