108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0809 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 
627 aa  1289    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  38.48 
 
 
806 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.21 
 
 
1050 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.62 
 
 
1495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  27.77 
 
 
1059 aa  148  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  27.77 
 
 
1059 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  29.37 
 
 
2457 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  26.21 
 
 
1020 aa  135  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  27.15 
 
 
1041 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  26.57 
 
 
323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  26.33 
 
 
1037 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  24.09 
 
 
689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  26.35 
 
 
1478 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  24.77 
 
 
374 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  26.13 
 
 
366 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  27.83 
 
 
423 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  22.92 
 
 
837 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.21 
 
 
697 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  26.87 
 
 
331 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  30.68 
 
 
820 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  27.78 
 
 
373 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  25.55 
 
 
321 aa  97.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  24.88 
 
 
495 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  25.56 
 
 
338 aa  95.5  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  24.03 
 
 
815 aa  94.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  25.06 
 
 
359 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  22.64 
 
 
337 aa  92.8  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  23.83 
 
 
370 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  24.81 
 
 
463 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  32.31 
 
 
474 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  25.45 
 
 
829 aa  90.5  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  29.51 
 
 
491 aa  90.5  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  25.84 
 
 
912 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.97 
 
 
778 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 
619 aa  89  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.56 
 
 
1019 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.25 
 
 
503 aa  88.2  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.8 
 
 
497 aa  87.4  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  22.62 
 
 
1018 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  23.38 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  30.97 
 
 
756 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  24.49 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  29.36 
 
 
1001 aa  85.5  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  25.62 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  28.17 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  25.71 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  29 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  26.05 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  23.89 
 
 
756 aa  84  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
678 aa  83.2  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.09 
 
 
454 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 
1077 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  27.35 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  25.85 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  34 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  25.7 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  28.09 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  25.19 
 
 
407 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  23.23 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  24.94 
 
 
382 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  28.26 
 
 
474 aa  77  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.88 
 
 
490 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  30 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  31.66 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  30.8 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  30.61 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  24.56 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  35.65 
 
 
619 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  23.38 
 
 
520 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  28 
 
 
376 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  25 
 
 
477 aa  72  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  27.8 
 
 
451 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  26.89 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  25.93 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  24.05 
 
 
690 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  34.43 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  28.78 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  21.47 
 
 
628 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  26.32 
 
 
317 aa  64.7  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  28 
 
 
399 aa  63.9  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  29.34 
 
 
398 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  25 
 
 
321 aa  62  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.15 
 
 
1146 aa  61.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  21.47 
 
 
387 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  35.96 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.400635 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  32.29 
 
 
355 aa  57.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  26.34 
 
 
770 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  30.28 
 
 
392 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  31.32 
 
 
1780 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  34.21 
 
 
561 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  31.82 
 
 
401 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  22.75 
 
 
388 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  24.31 
 
 
574 aa  51.2  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  21.93 
 
 
1331 aa  50.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  26.78 
 
 
370 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  25.77 
 
 
357 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  22.82 
 
 
997 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  31.25 
 
 
1242 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 
368 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>