More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0245 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  83.02 
 
 
692 aa  791    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 
1001 aa  2018    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  88.4 
 
 
815 aa  774    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  69.7 
 
 
472 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  65.69 
 
 
451 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  72.7 
 
 
820 aa  469  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  73.62 
 
 
474 aa  462  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  62.72 
 
 
756 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  58.89 
 
 
454 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  66.99 
 
 
497 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  67.76 
 
 
495 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  55.77 
 
 
829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  59.29 
 
 
457 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  70.97 
 
 
343 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  51.96 
 
 
457 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  60.71 
 
 
428 aa  365  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  60.6 
 
 
338 aa  354  5e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  56.29 
 
 
370 aa  347  5e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  57.67 
 
 
334 aa  322  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  57.88 
 
 
333 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  55.45 
 
 
338 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  41.9 
 
 
488 aa  290  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  41.71 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  67.16 
 
 
233 aa  274  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  69.39 
 
 
767 aa  270  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.55 
 
 
474 aa  266  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  46.65 
 
 
491 aa  265  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.24 
 
 
778 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  44.48 
 
 
678 aa  258  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  62.75 
 
 
380 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  63 
 
 
494 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  42.07 
 
 
490 aa  244  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  42.9 
 
 
309 aa  241  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  43.26 
 
 
423 aa  239  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  44.94 
 
 
543 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 
837 aa  238  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.05 
 
 
487 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  53.64 
 
 
411 aa  233  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  64.55 
 
 
225 aa  232  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  35.84 
 
 
477 aa  230  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  58.06 
 
 
221 aa  227  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  50.68 
 
 
524 aa  224  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  40.4 
 
 
371 aa  221  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  39.93 
 
 
333 aa  221  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  35.66 
 
 
451 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  56.08 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  63.64 
 
 
212 aa  215  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  36.61 
 
 
347 aa  209  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  36.9 
 
 
347 aa  206  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  36.96 
 
 
373 aa  205  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  43.24 
 
 
337 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  53.88 
 
 
212 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  35.94 
 
 
366 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  36.33 
 
 
1037 aa  197  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  48.5 
 
 
1160 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  35.58 
 
 
389 aa  194  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  37.67 
 
 
383 aa  194  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 
628 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  50.25 
 
 
683 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  34.81 
 
 
323 aa  191  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.34 
 
 
328 aa  191  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  46.52 
 
 
357 aa  190  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  36.03 
 
 
375 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  44.44 
 
 
298 aa  185  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  33.13 
 
 
689 aa  184  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  37.75 
 
 
1019 aa  183  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.51 
 
 
1059 aa  183  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  34.36 
 
 
376 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.51 
 
 
1059 aa  183  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.74 
 
 
1478 aa  180  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  36.09 
 
 
359 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  35.97 
 
 
324 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.2 
 
 
1041 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  49.48 
 
 
356 aa  178  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.58 
 
 
697 aa  177  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  34.58 
 
 
1495 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  32.57 
 
 
399 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  34.91 
 
 
398 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  31.66 
 
 
394 aa  173  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  34.29 
 
 
423 aa  171  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  35.06 
 
 
374 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  35.62 
 
 
1050 aa  168  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  30.89 
 
 
337 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  30.28 
 
 
486 aa  165  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  36.08 
 
 
619 aa  165  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 
317 aa  165  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  32.89 
 
 
370 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  34.49 
 
 
331 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  32.65 
 
 
321 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  33.76 
 
 
321 aa  162  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  31.45 
 
 
407 aa  161  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  35.02 
 
 
1020 aa  160  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  35.69 
 
 
1077 aa  155  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  32.45 
 
 
463 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  32.46 
 
 
357 aa  153  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  31.01 
 
 
369 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  31.1 
 
 
338 aa  152  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  28.14 
 
 
373 aa  152  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  35.23 
 
 
364 aa  152  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  31.48 
 
 
756 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>