31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0437 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 334 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  71.13 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  67.58 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  63.38 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  57.27 
 
 		 338 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  62.16 
 
 		 343 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  57.67 
 
 		 1001 aa  319  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  71.04 
 
 		 233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  59.09 
 
 		 692 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  74.35 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  75.26 
 
 		 767 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  74.07 
 
 		 494 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  61.54 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  60.51 
 
 		 524 aa  249  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  65.22 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  45.12 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  57.08 
 
 		 221 aa  238  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  51.56 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  55 
 
 		 212 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  54.38 
 
 		 212 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  52.78 
 
 		 1160 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  45.45 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  48.65 
 
 		 683 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  54.46 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  70.45 
 
 		 451 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  36.73 
 
 		 221 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  49.48 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  31.14 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  47.83 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  47.73 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  27.93 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>