29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0462 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 337 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  50.3 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  48.95 
 
 		 338 aa  278  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  46.77 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  43.98 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  42.81 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  52.68 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  44.54 
 
 		 1001 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  53.73 
 
 		 494 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  47.96 
 
 		 767 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  44.91 
 
 		 524 aa  176  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  42.9 
 
 		 692 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  43.32 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  94.19 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  42.37 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  47.57 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  42.08 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  44 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  41.88 
 
 		 1160 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  37.45 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  39.32 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  34.67 
 
 		 298 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 221 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 683 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  39.44 
 
 		 212 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  37.33 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  52.81 
 
 		 451 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  28.23 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  39.36 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>