More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0244 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  100 
 
 
692 aa  1347    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  81.66 
 
 
1001 aa  825    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  71.15 
 
 
343 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  58.45 
 
 
428 aa  360  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  60.77 
 
 
338 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  56.23 
 
 
333 aa  324  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  56.72 
 
 
334 aa  320  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  54.81 
 
 
338 aa  316  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  69.9 
 
 
767 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  63.3 
 
 
233 aa  270  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  66.15 
 
 
494 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  60.45 
 
 
380 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  51.49 
 
 
411 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  45.98 
 
 
336 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  52.36 
 
 
524 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  56.68 
 
 
221 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  55.51 
 
 
225 aa  223  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  63.07 
 
 
212 aa  210  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  49.78 
 
 
212 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  47.37 
 
 
1160 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  41.45 
 
 
337 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  46.02 
 
 
683 aa  197  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  48.46 
 
 
357 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  45.65 
 
 
298 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  50.52 
 
 
356 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  44.77 
 
 
503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  38.95 
 
 
373 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  41.11 
 
 
227 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 
292 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  38.89 
 
 
417 aa  135  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 
465 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
247 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  40.31 
 
 
320 aa  129  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 
465 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
522 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  38.37 
 
 
291 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
387 aa  122  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.11 
 
 
468 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1687  polysaccharide deacetylase  42.2 
 
 
336 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000644335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  38.67 
 
 
488 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
267 aa  118  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 
199 aa  118  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.84 
 
 
251 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 
240 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.98 
 
 
279 aa  115  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  35.32 
 
 
287 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  34.25 
 
 
291 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
307 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
247 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 
317 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
324 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
256 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
255 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  34.29 
 
 
373 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
204 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.71 
 
 
413 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 
258 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  34.74 
 
 
249 aa  107  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 
1120 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  35 
 
 
237 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 
263 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 
238 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
352 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 
295 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
283 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.68 
 
 
275 aa  104  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.63 
 
 
440 aa  104  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 
299 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
276 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
275 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
1124 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
542 aa  103  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 
1115 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
275 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
275 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
275 aa  103  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
275 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 
275 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
275 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
285 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
537 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 
927 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.05 
 
 
1115 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.05 
 
 
1119 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.05 
 
 
1115 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  36.3 
 
 
327 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 
1115 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 
221 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
871 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
275 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 
344 aa  100  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 
522 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
321 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
752 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.71 
 
 
305 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.48 
 
 
301 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
251 aa  99  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 
353 aa  99  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>