More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1687 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1687  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 336 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000644335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  51.14 
 
 		 767 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  55.37 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  42.94 
 
 		 1001 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  42.61 
 
 		 692 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  38.29 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 465 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.14 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  44.07 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 267 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 227 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  30.68 
 
 		 488 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.78 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 465 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 229 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.02 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  29.89 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 542 aa  82.8  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  29.28 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.98 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  28.41 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  25.84 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 217 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.6 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  23.43 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  26.58 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 		 221 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  24.16 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 522 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 413 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  25.25 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.02 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  26.7 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.27 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  29.51 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  27.53 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 683 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  25.28 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  28.02 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  25.57 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  25.53 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.33 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>