More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2067 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 356 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  78.87 
 
 		 348 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  76.62 
 
 		 346 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  62.01 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  61.6 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  61.22 
 
 		 350 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  60.31 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  56.76 
 
 		 311 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  56.42 
 
 		 322 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  55.22 
 
 		 310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  51.02 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  56.59 
 
 		 260 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  52.52 
 
 		 312 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  43.44 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  38.65 
 
 		 427 aa  176  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  37.55 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  42.15 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 439 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  41.33 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  39.21 
 
 		 256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  38.91 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  39.07 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 		 265 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 265 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.63 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.86 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 503 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  34.41 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 256 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 1124 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 		 1115 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.19 
 
 		 1115 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.19 
 
 		 1119 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.42 
 
 		 488 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 1101 aa  95.9  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 1115 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.32 
 
 		 468 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 277 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 898 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 405 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.72 
 
 		 1115 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 283 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.85 
 
 		 279 aa  92.8  8e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 267 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 1120 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.92 
 
 		 927 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 258 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 204 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 221 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  30 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 752 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 890 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 247 aa  89.7  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 276 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.99 
 
 		 275 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.8 
 
 		 251 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.92 
 
 		 872 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 		 520 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 352 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 204 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>