More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3558 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  100 
 
 		 321 aa  627  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  53.57 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  51.01 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  52.2 
 
 		 202 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  46.28 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  44.05 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  45.55 
 
 		 1780 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  41.41 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.71 
 
 		 251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  39 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 217 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 264 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 221 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  51.91 
 
 		 205 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 		 212 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.89 
 
 		 1101 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.67 
 
 		 927 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 220 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 353 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.77 
 
 		 872 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.65 
 
 		 1119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.93 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.65 
 
 		 1115 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.65 
 
 		 1115 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.65 
 
 		 1115 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 215 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.8 
 
 		 241 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 217 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.96 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  35.22 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  30.81 
 
 		 244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.3 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 		 1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.35 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.91 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 		 413 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  30.39 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 1124 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.78 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 430 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  37.3 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.47 
 
 		 1099 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 		 542 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 204 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.94 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  37.34 
 
 		 199 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 752 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 522 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  36.2 
 
 		 465 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 789 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 789 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 789 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 		 175 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 302 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 1118 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 		 250 aa  99.4  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>