More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2063 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
248 aa  487  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  64.68 
 
 
247 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  53.43 
 
 
291 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  44.39 
 
 
468 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  48.53 
 
 
503 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  43.26 
 
 
287 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  47.64 
 
 
267 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  43.14 
 
 
307 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
292 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  40.54 
 
 
373 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  40.29 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  39.02 
 
 
488 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  40.31 
 
 
522 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  43.9 
 
 
542 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
345 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  42.33 
 
 
217 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  38.8 
 
 
324 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  37.67 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  48.88 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 
387 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 
537 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
368 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  37 
 
 
520 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 
320 aa  128  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
413 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  37.37 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  40.88 
 
 
229 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.61 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.69 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  34.76 
 
 
417 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
465 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 
244 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  38.27 
 
 
215 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.66 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 
291 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.76 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
405 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 
305 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 
240 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 
353 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
317 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
220 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.08 
 
 
241 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
216 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.5 
 
 
275 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.26 
 
 
241 aa  111  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
354 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  33.85 
 
 
244 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
217 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  34.03 
 
 
244 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
344 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 
258 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  37.21 
 
 
1001 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
372 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
262 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 
256 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
245 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
246 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  41.08 
 
 
465 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
413 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  40.22 
 
 
317 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.89 
 
 
260 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 
295 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.89 
 
 
244 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  29.84 
 
 
260 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 
1124 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 
259 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  40.66 
 
 
259 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 
285 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
260 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.84 
 
 
260 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
260 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>