More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3002 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
354 aa  718    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  47.29 
 
 
573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  46.29 
 
 
571 aa  308  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.81 
 
 
440 aa  183  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  45 
 
 
251 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  43.37 
 
 
305 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  41.92 
 
 
302 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  41.88 
 
 
285 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  40.5 
 
 
244 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  41.29 
 
 
220 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  40.4 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 
241 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  40.31 
 
 
259 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  41.21 
 
 
353 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  40.3 
 
 
244 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 
241 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 
213 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 
213 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 
213 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  41.09 
 
 
241 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
217 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  41.46 
 
 
241 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
317 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  39 
 
 
204 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  38.69 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  36.04 
 
 
279 aa  127  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  36.54 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
413 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  37.44 
 
 
244 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.5 
 
 
250 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 
215 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  35.1 
 
 
212 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  34.63 
 
 
216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.04 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.54 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.06 
 
 
1115 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  37.32 
 
 
1124 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 
752 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 
1154 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  37.67 
 
 
1120 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 
202 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.71 
 
 
1099 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.73 
 
 
1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.73 
 
 
1119 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.73 
 
 
1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.18 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
522 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 
267 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 
258 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
264 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  36.32 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
248 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.17 
 
 
244 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
221 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 
258 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.92 
 
 
1115 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.25 
 
 
872 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.62 
 
 
927 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
1101 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
322 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
387 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.48 
 
 
542 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
405 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
313 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 
227 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 
312 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
240 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  33.16 
 
 
211 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
537 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  37.75 
 
 
242 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  34.17 
 
 
287 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37 
 
 
250 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  32.34 
 
 
373 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  36.49 
 
 
488 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
311 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.38 
 
 
275 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 
255 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 
307 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 
219 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
1118 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
324 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
263 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.21 
 
 
344 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.56 
 
 
468 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
275 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>