More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4917 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  81.86 
 
 
215 aa  357  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  68.06 
 
 
217 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  61.29 
 
 
219 aa  274  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  58.67 
 
 
232 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  56 
 
 
175 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  43.01 
 
 
285 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  43.46 
 
 
259 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.81 
 
 
251 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  41.45 
 
 
283 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
317 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 
353 aa  147  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  40.41 
 
 
229 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  35.94 
 
 
364 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
241 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 
305 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
220 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.38 
 
 
241 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 
217 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.38 
 
 
244 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  36.84 
 
 
244 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  42.19 
 
 
227 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.86 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  40.54 
 
 
284 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.12 
 
 
373 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.31 
 
 
241 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  34.33 
 
 
260 aa  131  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
317 aa  131  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.56 
 
 
417 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 
542 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.35 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  32.32 
 
 
211 aa  127  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.84 
 
 
260 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
263 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.5 
 
 
267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.63 
 
 
1099 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
204 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 
244 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
345 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  39.15 
 
 
202 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
275 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 
302 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
275 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
275 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
275 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
275 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.6 
 
 
321 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.11 
 
 
275 aa  121  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  36.32 
 
 
373 aa  121  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 
264 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  38.37 
 
 
299 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.68 
 
 
265 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  31.19 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.32 
 
 
440 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.66 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 
321 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 
387 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.43 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 
413 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  35.1 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
368 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
301 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
264 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
248 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 
372 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
503 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  44.97 
 
 
205 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  45.8 
 
 
352 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 
360 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.9 
 
 
468 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
465 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
752 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
1101 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>