More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3831 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  72.57 
 
 
219 aa  266  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  62.86 
 
 
217 aa  230  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  57.71 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  58.86 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  56 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 
317 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  43.02 
 
 
283 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 
284 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
241 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
213 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 
317 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.48 
 
 
241 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  34.32 
 
 
244 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.33 
 
 
244 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
217 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
241 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.95 
 
 
251 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 
285 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.33 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 
353 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.71 
 
 
229 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 
263 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
263 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 
216 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  31.21 
 
 
364 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 
413 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 
324 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 
352 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.72 
 
 
250 aa  101  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.14 
 
 
321 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  30.81 
 
 
211 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.67 
 
 
1099 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
202 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
248 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 
387 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 
542 aa  98.6  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.81 
 
 
260 aa  98.6  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  39.71 
 
 
227 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
251 aa  98.2  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
247 aa  97.4  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.86 
 
 
373 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.07 
 
 
253 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  28.32 
 
 
327 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  35.67 
 
 
264 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
405 aa  94.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
299 aa  94  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 
244 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.9 
 
 
258 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.49 
 
 
251 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  30.83 
 
 
321 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 
275 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 
276 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.18 
 
 
440 aa  93.2  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.18 
 
 
244 aa  93.2  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  27.06 
 
 
299 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
299 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
299 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
299 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
299 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
299 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
275 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.5 
 
 
468 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 
256 aa  92.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
254 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
254 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 
404 aa  91.7  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  31.29 
 
 
254 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  31.29 
 
 
254 aa  91.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
254 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
254 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
299 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  30.81 
 
 
299 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
275 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
275 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
275 aa  91.3  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
275 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
275 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
275 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  30.81 
 
 
299 aa  90.9  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  30.67 
 
 
254 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
286 aa  90.9  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.67 
 
 
254 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
503 aa  90.9  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.84 
 
 
417 aa  90.9  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 
299 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  28.16 
 
 
275 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 
236 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  38.35 
 
 
537 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  41.73 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 
240 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
254 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.67 
 
 
254 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
337 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>