More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5017 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  38.17 
 
 		 279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 212 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.83 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  34.65 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 368 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 317 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 353 aa  117  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 321 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 405 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  33.17 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  35.59 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.15 
 
 		 417 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 285 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 871 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.77 
 
 		 468 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 324 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  38.41 
 
 		 321 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 413 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.39 
 
 		 321 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 372 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 294 aa  104  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 354 aa  104  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 		 344 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.41 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  31.41 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.41 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.41 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.41 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  30.61 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 404 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  34.76 
 
 		 327 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 387 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 275 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  33.73 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  29.15 
 
 		 364 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 320 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 286 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 267 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.38 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  30.32 
 
 		 903 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 175 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  32.96 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 430 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.37 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.89 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 		 275 aa  99  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 900 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  33.8 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 890 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 520 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 537 aa  98.6  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  30.16 
 
 		 299 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.85 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 299 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 264 aa  98.6  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 299 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.93 
 
 		 1119 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 299 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 299 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 299 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.41 
 
 		 1115 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 522 aa  98.2  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  30.6 
 
 		 244 aa  98.2  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.93 
 
 		 1115 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.93 
 
 		 1115 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>