More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2978 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  61.81 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  47.86 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  45.51 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  43.37 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  44.76 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  47.62 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.6 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  47.1 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  51.91 
 
 		 321 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  44.72 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  44.97 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  44.3 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 405 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  41.96 
 
 		 353 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  40.14 
 
 		 404 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 		 1118 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 244 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  42.96 
 
 		 413 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.97 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  41.82 
 
 		 364 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.97 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  43.18 
 
 		 409 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  35.97 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 		 430 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.97 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.25 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 		 320 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  39.01 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 		 302 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.25 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.25 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.25 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  35.21 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.25 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 301 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 258 aa  97.8  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.24 
 
 		 250 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 		 1101 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  38.98 
 
 		 752 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 		 1115 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 276 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 1124 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  41.45 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 305 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 413 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.8 
 
 		 244 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  40.69 
 
 		 542 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 289 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.42 
 
 		 927 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.42 
 
 		 1115 aa  95.5  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.42 
 
 		 1119 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 		 1115 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  34.72 
 
 		 872 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  40.49 
 
 		 287 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.23 
 
 		 244 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  42.5 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  37.93 
 
 		 1099 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 372 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 		 294 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 275 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.03 
 
 		 1115 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 275 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 275 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  36.03 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 294 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.38 
 
 		 373 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  34.46 
 
 		 417 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 354 aa  92.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  34.04 
 
 		 321 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 321 aa  92  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.11 
 
 		 275 aa  92  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  38.13 
 
 		 280 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  30.61 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 289 aa  91.3  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 		 465 aa  91.3  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 258 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 		 409 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 522 aa  90.5  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  37.41 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 352 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  35.85 
 
 		 300 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  41.73 
 
 		 175 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  40.83 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  40.83 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>