More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0292 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
317 aa  627  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  61.51 
 
 
284 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  47.4 
 
 
364 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  48.89 
 
 
244 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  45.77 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  45.64 
 
 
217 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 
232 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  46.91 
 
 
321 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  42.36 
 
 
215 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  44.38 
 
 
216 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.02 
 
 
251 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  41.78 
 
 
259 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
212 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  41.01 
 
 
285 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  45.35 
 
 
202 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  45.9 
 
 
353 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 
175 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  40.56 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  40.56 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  40.56 
 
 
213 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  40.56 
 
 
241 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  40.56 
 
 
213 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.89 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  39.44 
 
 
220 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  38.89 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  39.44 
 
 
241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.89 
 
 
241 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  43.02 
 
 
229 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  42.13 
 
 
413 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 
405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  38.76 
 
 
244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  41.11 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 
275 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 
276 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  38.42 
 
 
275 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 
205 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  39.64 
 
 
404 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  45.2 
 
 
227 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 
275 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 
305 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  38.42 
 
 
373 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
275 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
275 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
275 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
275 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 
275 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
430 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
320 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  37.85 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.36 
 
 
275 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 
409 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 
324 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
247 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.8 
 
 
417 aa  116  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  36.42 
 
 
479 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
413 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  41.71 
 
 
542 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 
479 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.93 
 
 
387 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.59 
 
 
571 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.67 
 
 
1115 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.67 
 
 
1115 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.67 
 
 
1119 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.8 
 
 
267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 
1115 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
1101 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  40.66 
 
 
1099 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
409 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  31.1 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.14 
 
 
244 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
277 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  39.87 
 
 
246 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 
242 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  34.66 
 
 
481 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
1120 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.98 
 
 
573 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.71 
 
 
927 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 
242 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 
522 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.56 
 
 
1115 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 
256 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 
240 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 
352 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
263 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>