More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1069 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40.52 
 
 
251 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.9 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
241 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
213 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
241 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
213 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
213 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
213 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.88 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.7 
 
 
241 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.88 
 
 
217 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
221 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  39.22 
 
 
244 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 
275 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
275 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
275 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 
305 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 
204 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 
276 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  38.34 
 
 
275 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
264 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  38.07 
 
 
417 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
267 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 
320 aa  141  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
372 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
404 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
405 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
239 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
239 aa  134  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  37.34 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
368 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  36.32 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
387 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 
683 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.15 
 
 
1119 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
1115 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.15 
 
 
927 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.15 
 
 
1115 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.47 
 
 
1115 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 
302 aa  131  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  36.79 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
465 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  34.16 
 
 
872 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.16 
 
 
1115 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 
204 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  36.98 
 
 
289 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.8 
 
 
1099 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  37.81 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
479 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  36.27 
 
 
234 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
430 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  38.69 
 
 
354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.85 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
307 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
234 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 
413 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  35.75 
 
 
234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 
1154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
227 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
317 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  35.53 
 
 
481 aa  124  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  35.32 
 
 
479 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  36.6 
 
 
234 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 
1124 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 
217 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.44 
 
 
250 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
234 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
219 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 
232 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
236 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
263 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 
752 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  36.36 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  36.42 
 
 
321 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
308 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
261 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
294 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
344 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>