More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0397 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 
1115 aa  723    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.63 
 
 
1115 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  39.02 
 
 
927 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.63 
 
 
1115 aa  719    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
1124 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.42 
 
 
1119 aa  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.89 
 
 
1115 aa  720    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
1101 aa  686    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
1154 aa  2377    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
1118 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  39.46 
 
 
872 aa  629  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 
1120 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
1002 aa  492  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.99 
 
 
1099 aa  396  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
752 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  33.24 
 
 
789 aa  327  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  33.24 
 
 
789 aa  327  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  33.24 
 
 
789 aa  327  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 
637 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
549 aa  204  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
509 aa  191  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
428 aa  177  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
464 aa  171  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  36.65 
 
 
403 aa  164  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.83 
 
 
461 aa  161  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 
464 aa  159  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  38.14 
 
 
422 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
479 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
425 aa  153  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
479 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
479 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.76 
 
 
204 aa  148  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  39.06 
 
 
421 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  39.06 
 
 
421 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
410 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  38.63 
 
 
421 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
483 aa  142  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  30.42 
 
 
480 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.65 
 
 
241 aa  140  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 
220 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  36.71 
 
 
241 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.86 
 
 
244 aa  138  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
495 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
470 aa  137  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
217 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
213 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
213 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
213 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
213 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
429 aa  137  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.29 
 
 
241 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
466 aa  137  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 
422 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.98 
 
 
241 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  31.96 
 
 
433 aa  136  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  29.68 
 
 
451 aa  135  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
229 aa  135  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  37.9 
 
 
264 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
259 aa  134  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.91 
 
 
251 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  33.04 
 
 
441 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
441 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  33.04 
 
 
441 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
658 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  33.04 
 
 
441 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  33.04 
 
 
441 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  33.04 
 
 
412 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  33.04 
 
 
412 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  31.41 
 
 
423 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  32.77 
 
 
423 aa  131  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  31.18 
 
 
442 aa  131  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.66 
 
 
411 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
445 aa  130  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
413 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  32.34 
 
 
423 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  30.74 
 
 
399 aa  130  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  25.67 
 
 
374 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  30.74 
 
 
399 aa  130  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  30.16 
 
 
425 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  30.16 
 
 
425 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  32.77 
 
 
423 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  32.77 
 
 
423 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  32.77 
 
 
423 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  31.12 
 
 
424 aa  128  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  30.8 
 
 
442 aa  127  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 
475 aa  127  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  33.9 
 
 
423 aa  126  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
320 aa  126  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
469 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 
247 aa  125  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 
276 aa  125  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  31.7 
 
 
417 aa  125  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.18 
 
 
275 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 
275 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 
275 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 
275 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 
275 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 
275 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  31.86 
 
 
412 aa  123  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
475 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>