More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10838 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  100 
 
 
480 aa  997    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  60.99 
 
 
478 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  30.02 
 
 
433 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
648 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.81 
 
 
397 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 
549 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
485 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
485 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
485 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 
1154 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
415 aa  136  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.4 
 
 
872 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.65 
 
 
1119 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.01 
 
 
1115 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.01 
 
 
927 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.01 
 
 
1115 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
1115 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  33.94 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
752 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 
1115 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
426 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
426 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
484 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.62 
 
 
1099 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 
1120 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  31.38 
 
 
694 aa  113  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 
1124 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.47 
 
 
411 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
637 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3194  Hyaluronan synthase  27.46 
 
 
531 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.16 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 
1101 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.18 
 
 
505 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
428 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
789 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
789 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
789 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.16 
 
 
421 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
509 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
509 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.16 
 
 
421 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.09 
 
 
461 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  26.18 
 
 
520 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
1002 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  26.18 
 
 
662 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  24.68 
 
 
433 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  26.85 
 
 
447 aa  107  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 
450 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1161  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
531 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
520 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
445 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
520 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
520 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.78 
 
 
399 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25.82 
 
 
633 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  23.9 
 
 
442 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.78 
 
 
399 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
476 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
395 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.53 
 
 
442 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
475 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
494 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 
1118 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
425 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
446 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28.05 
 
 
497 aa  100  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
399 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  24.01 
 
 
418 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
658 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 
444 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0358  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
458 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  24.9 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 
444 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.88 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  22.4 
 
 
423 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 
444 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
464 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
420 aa  97.8  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  22 
 
 
423 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  21.95 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
495 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.3 
 
 
425 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  26.8 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.3 
 
 
425 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  25.89 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28550  glycosyl transferase  24.87 
 
 
449 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00136572  normal  0.0940176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  22.69 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  22.69 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  22.69 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  22.69 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  22.69 
 
 
412 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  22.69 
 
 
412 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
378 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  22 
 
 
423 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>