More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0285 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
476 aa  967    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  57.24 
 
 
446 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  57.63 
 
 
662 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  56.26 
 
 
509 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  57.77 
 
 
505 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  57.77 
 
 
520 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  55.33 
 
 
633 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  57.21 
 
 
509 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 
520 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 
520 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 
520 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
399 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  33.41 
 
 
483 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
546 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
508 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
1101 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
475 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
475 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
549 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
488 aa  133  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  29.35 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
501 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
501 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
688 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 
752 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
501 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 
1120 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
492 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.15 
 
 
1115 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
476 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.15 
 
 
927 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.08 
 
 
1115 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.15 
 
 
1115 aa  123  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.07 
 
 
1119 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 
1118 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 
789 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 
789 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
502 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 
789 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  35.86 
 
 
461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
1115 aa  120  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
533 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
494 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
509 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  29.62 
 
 
872 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
433 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  30.4 
 
 
458 aa  118  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.78 
 
 
1099 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
428 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
1002 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  31.69 
 
 
441 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
441 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  27.34 
 
 
433 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  31.69 
 
 
441 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  31.69 
 
 
441 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
523 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
637 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  31.69 
 
 
441 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  31.69 
 
 
412 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  31.69 
 
 
412 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  25.71 
 
 
423 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
439 aa  113  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
905 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  26.09 
 
 
490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
433 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.58 
 
 
433 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  26.58 
 
 
433 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  26.58 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  26.58 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  26.52 
 
 
425 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  26.52 
 
 
425 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
433 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
468 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
1124 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
410 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  29.89 
 
 
497 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.81 
 
 
411 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  30.12 
 
 
469 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
438 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.81 
 
 
403 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
443 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  28.62 
 
 
424 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
494 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
443 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
429 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  24.49 
 
 
478 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  25.66 
 
 
418 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  27.13 
 
 
514 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  30.62 
 
 
439 aa  103  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  24.9 
 
 
480 aa  103  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
919 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>