More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1567 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
492 aa  1003    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  43.38 
 
 
546 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  43.76 
 
 
501 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 
501 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 
501 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  45.47 
 
 
501 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  41.4 
 
 
505 aa  332  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  44.72 
 
 
488 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  43.03 
 
 
508 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
494 aa  302  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  38.32 
 
 
490 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  41.71 
 
 
688 aa  266  8e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 
533 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
523 aa  243  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 
443 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  33.11 
 
 
514 aa  221  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  37.57 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  37.47 
 
 
586 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.56 
 
 
505 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30.56 
 
 
520 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.09 
 
 
662 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_25890  predicted protein  33.1 
 
 
825 aa  136  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.422329  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.19 
 
 
633 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 
509 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
476 aa  126  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.74 
 
 
672 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  32.74 
 
 
672 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  33.99 
 
 
661 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
473 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.03 
 
 
672 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  27.91 
 
 
501 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
520 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
520 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  31.34 
 
 
664 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.1 
 
 
664 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  30.39 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  27.99 
 
 
726 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.15 
 
 
730 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  32.83 
 
 
666 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  30.23 
 
 
740 aa  117  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  27.65 
 
 
895 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.86 
 
 
730 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  30.38 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.06 
 
 
851 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
468 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.71 
 
 
822 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  34.11 
 
 
869 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 
1124 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  31.5 
 
 
707 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.95 
 
 
831 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.95 
 
 
834 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
889 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
620 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.95 
 
 
804 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  32.2 
 
 
443 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  25.32 
 
 
741 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  29.41 
 
 
872 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.41 
 
 
872 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  29.41 
 
 
872 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  29.41 
 
 
872 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  29.41 
 
 
872 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  29.41 
 
 
872 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
868 aa  110  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
446 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  29.21 
 
 
874 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  29.07 
 
 
872 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  32.17 
 
 
869 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  26.21 
 
 
788 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  32.17 
 
 
869 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  26.21 
 
 
788 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  28.86 
 
 
872 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  31.79 
 
 
439 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  28.87 
 
 
874 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  28.47 
 
 
899 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  28.76 
 
 
867 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  28.87 
 
 
874 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  28.87 
 
 
874 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  29.39 
 
 
872 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  28.87 
 
 
874 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  28.14 
 
 
872 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  29.79 
 
 
749 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25.96 
 
 
737 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
1129 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
650 aa  107  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
393 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.53 
 
 
810 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
678 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
889 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  28.38 
 
 
899 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
899 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  26.11 
 
 
788 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>