More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2860 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  82.5 
 
 		 889 aa  1504    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  55.31 
 
 		 905 aa  981    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  84.96 
 
 		 944 aa  1610    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 		 889 aa  671    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 899 aa  1830    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  84.19 
 
 		 919 aa  1570    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  94.44 
 
 		 895 aa  1747    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  83.54 
 
 		 889 aa  1532    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  41.54 
 
 		 844 aa  659    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  77.53 
 
 		 895 aa  1399    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 		 885 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  40.33 
 
 		 863 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  39.4 
 
 		 869 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 		 863 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 		 862 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 863 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  38.84 
 
 		 863 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 903 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  37.47 
 
 		 917 aa  535  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 		 831 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.4 
 
 		 842 aa  499  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 		 868 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 859 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  33.27 
 
 		 772 aa  244  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  37.39 
 
 		 535 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 610 aa  211  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  40.13 
 
 		 541 aa  208  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 		 531 aa  208  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  36.34 
 
 		 540 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  37.39 
 
 		 536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  38.39 
 
 		 522 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 521 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  38.06 
 
 		 533 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40 
 
 		 521 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  37.84 
 
 		 558 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  40 
 
 		 525 aa  197  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  38.48 
 
 		 558 aa  197  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  37.24 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.41 
 
 		 650 aa  193  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  37.54 
 
 		 638 aa  191  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  37.57 
 
 		 541 aa  191  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 529 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  38.19 
 
 		 494 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  37.04 
 
 		 532 aa  185  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  28.23 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 501 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 501 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.97 
 
 		 295 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 		 295 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 501 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 501 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 533 aa  122  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  32.32 
 
 		 788 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  32.32 
 
 		 788 aa  121  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  27.66 
 
 		 740 aa  120  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  31 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  26.77 
 
 		 716 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  32.12 
 
 		 778 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.45 
 
 		 652 aa  118  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  30.45 
 
 		 652 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.51 
 
 		 768 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.1 
 
 		 712 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.78 
 
 		 672 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 546 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.51 
 
 		 672 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 505 aa  114  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  28.52 
 
 		 666 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 488 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 494 aa  113  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.29 
 
 		 652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  28.85 
 
 		 672 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.37 
 
 		 831 aa  112  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.91 
 
 		 930 aa  111  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  30.04 
 
 		 749 aa  112  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  29.54 
 
 		 737 aa  111  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.52 
 
 		 794 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.98 
 
 		 834 aa  109  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.78 
 
 		 503 aa  109  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.5 
 
 		 586 aa  110  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 658 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.08 
 
 		 822 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.74 
 
 		 811 aa  108  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.51 
 
 		 810 aa  108  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.13 
 
 		 804 aa  108  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  30.14 
 
 		 726 aa  107  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 		 620 aa  107  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 1140 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  27.94 
 
 		 661 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 659 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  26.37 
 
 		 624 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  25.17 
 
 		 490 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.75 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.75 
 
 		 520 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 1140 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 514 aa  105  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 492 aa  105  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 509 aa  105  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.8 
 
 		 980 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.05 
 
 		 662 aa  104  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>