More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4423 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  52.47 
 
 
944 aa  945    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  56.46 
 
 
895 aa  990    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
844 aa  655    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  55.63 
 
 
889 aa  976    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
889 aa  666    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  55.21 
 
 
899 aa  990    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  53.74 
 
 
919 aa  973    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  54.99 
 
 
895 aa  999    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  55.23 
 
 
889 aa  984    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
905 aa  1839    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
903 aa  555  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 
885 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  37.49 
 
 
868 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  37.63 
 
 
869 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
863 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
862 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  37.18 
 
 
863 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
863 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  37.64 
 
 
863 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
917 aa  502  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
859 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 
831 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.02 
 
 
842 aa  476  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 
772 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  42.32 
 
 
638 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.89 
 
 
522 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.13 
 
 
521 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  40.13 
 
 
525 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 
521 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
610 aa  210  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  39.74 
 
 
533 aa  209  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  37.54 
 
 
558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  37.28 
 
 
558 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  36.31 
 
 
531 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  40.06 
 
 
541 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.56 
 
 
650 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  38.23 
 
 
540 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  37.8 
 
 
536 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  37.95 
 
 
541 aa  193  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  37.19 
 
 
538 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 
529 aa  187  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  36.62 
 
 
494 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  34 
 
 
535 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  37.5 
 
 
532 aa  177  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 
295 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  33.57 
 
 
295 aa  143  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
546 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  30.18 
 
 
716 aa  125  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
501 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.64 
 
 
652 aa  121  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  31.75 
 
 
652 aa  121  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  28.5 
 
 
666 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
494 aa  120  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.15 
 
 
652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  30 
 
 
712 aa  119  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
501 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
501 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.25 
 
 
778 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  28.25 
 
 
501 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  27.86 
 
 
740 aa  117  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
501 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  28.49 
 
 
661 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
533 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
446 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.96 
 
 
672 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.07 
 
 
1135 aa  114  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
505 aa  113  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.33 
 
 
672 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  29.96 
 
 
672 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.37 
 
 
503 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
659 aa  111  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.9 
 
 
544 aa  111  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  31.32 
 
 
788 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  31.32 
 
 
788 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.08 
 
 
768 aa  111  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  26.63 
 
 
490 aa  110  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
488 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  34.17 
 
 
422 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  29.71 
 
 
659 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
658 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
508 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.32 
 
 
657 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.32 
 
 
657 aa  108  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  27.32 
 
 
655 aa  108  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.22 
 
 
980 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
591 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  27.73 
 
 
749 aa  107  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  27.04 
 
 
657 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  27.04 
 
 
655 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
650 aa  106  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  27.04 
 
 
655 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  27.04 
 
 
655 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
1140 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.79 
 
 
520 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.89 
 
 
586 aa  105  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.41 
 
 
1115 aa  105  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  29.78 
 
 
788 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 
927 aa  105  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
514 aa  105  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>