60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2930 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  71.32 
 
 		 532 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  83.02 
 
 		 558 aa  902    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  72.01 
 
 		 541 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  74.49 
 
 		 494 aa  732    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  83.21 
 
 		 558 aa  900    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  100 
 
 		 536 aa  1080    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  72.23 
 
 		 538 aa  797    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  44.38 
 
 		 541 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  54.61 
 
 		 540 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  38 
 
 		 531 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  38.38 
 
 		 522 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  44.91 
 
 		 533 aa  283  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  38.04 
 
 		 521 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  37.75 
 
 		 525 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  45.06 
 
 		 521 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  36.11 
 
 		 638 aa  273  8.000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  33.52 
 
 		 650 aa  265  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  33.46 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  33.97 
 
 		 529 aa  233  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 844 aa  211  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  36.14 
 
 		 869 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 		 889 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 919 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 		 889 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 895 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  40 
 
 		 895 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 899 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 862 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  34.12 
 
 		 863 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 863 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 		 863 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 903 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 905 aa  193  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 885 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 917 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 944 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  36.18 
 
 		 863 aa  187  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 		 868 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 889 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 859 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 		 842 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 831 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.58 
 
 		 295 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 295 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  27.86 
 
 		 308 aa  92.8  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  23.55 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  30.15 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  26.04 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  27.14 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  28.4 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.89 
 
 		 1290 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 321 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  27.27 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  24.4 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  26.15 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  22.75 
 
 		 249 aa  53.5  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  24.41 
 
 		 465 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  25.99 
 
 		 555 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  24.02 
 
 		 649 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  22.04 
 
 		 620 aa  47.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>