56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3720 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 336 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  73.68 
 
 		 321 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.6 
 
 		 1290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  31.27 
 
 		 863 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 868 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  30.82 
 
 		 863 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 862 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 863 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 831 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 863 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 903 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  27.74 
 
 		 869 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 859 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 885 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 917 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  27.48 
 
 		 620 aa  99.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.62 
 
 		 842 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 844 aa  93.6  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  29.66 
 
 		 532 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  26.9 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  27.93 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  26.55 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  27.68 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  30.15 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  24.57 
 
 		 895 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  25.86 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 889 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  24.91 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  26.56 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  26.51 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  30.15 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 		 889 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  28.57 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  27.41 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  26.67 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 899 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 895 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 889 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  29.23 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  26.49 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  21.84 
 
 		 529 aa  69.7  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 		 944 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  28.37 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 905 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  25.26 
 
 		 535 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  23.22 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  23.88 
 
 		 555 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  32.23 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  22.19 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0190  hypothetical protein  28.46 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3567  hypothetical protein  35 
 
 		 1798 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621176 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  23.73 
 
 		 649 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>