56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28554 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  100 
 
 		 555 aa  1140    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  33.91 
 
 		 649 aa  189  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  31.43 
 
 		 249 aa  136  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 859 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 844 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 889 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  27.14 
 
 		 869 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.99 
 
 		 842 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 868 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 863 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 831 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 903 aa  93.2  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 917 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  30.7 
 
 		 638 aa  91.7  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 862 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 895 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 863 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 899 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  27.03 
 
 		 650 aa  90.1  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  26.88 
 
 		 863 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  24.82 
 
 		 538 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 889 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  28.52 
 
 		 366 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  25.78 
 
 		 541 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  28.91 
 
 		 863 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  24.31 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 889 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  29.2 
 
 		 895 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  27.35 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  23.55 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  27.86 
 
 		 541 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  23.7 
 
 		 308 aa  83.2  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 885 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 919 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  23.92 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 521 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  27.59 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  23.94 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  24.3 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  23.16 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  25.1 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 905 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  24.28 
 
 		 521 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 295 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  24.78 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  24.45 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  24.28 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  27.44 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  25.12 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 529 aa  66.6  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  25.75 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 944 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  24.68 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  23.88 
 
 		 336 aa  51.2  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  25.13 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>