More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4093 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  46.34 
 
 		 903 aa  748    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  83.1 
 
 		 863 aa  1442    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  96.26 
 
 		 863 aa  1673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  95.91 
 
 		 863 aa  1669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.31 
 
 		 842 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 863 aa  1774    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  52.32 
 
 		 831 aa  860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 		 917 aa  770    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  86.71 
 
 		 885 aa  1519    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  97.07 
 
 		 862 aa  1675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 		 859 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  41.44 
 
 		 868 aa  661    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  76.65 
 
 		 869 aa  1383    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  40.12 
 
 		 895 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  38.97 
 
 		 899 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 		 889 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 		 889 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 895 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 		 944 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 844 aa  560  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 919 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 		 889 aa  543  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 		 905 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 		 772 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  40.51 
 
 		 541 aa  233  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.2 
 
 		 650 aa  219  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 		 529 aa  219  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  39.19 
 
 		 610 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  40.69 
 
 		 525 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.69 
 
 		 521 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 		 531 aa  211  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  38.02 
 
 		 521 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.55 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  36.62 
 
 		 533 aa  206  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  37.91 
 
 		 535 aa  204  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  35.28 
 
 		 536 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  34.25 
 
 		 538 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  34.42 
 
 		 638 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  33.42 
 
 		 558 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  34.69 
 
 		 558 aa  195  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  37.82 
 
 		 540 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  32.2 
 
 		 494 aa  188  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  34.78 
 
 		 532 aa  188  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  32.52 
 
 		 541 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 295 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  29.39 
 
 		 295 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  29.85 
 
 		 652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.61 
 
 		 652 aa  132  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 658 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.7 
 
 		 768 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  28.95 
 
 		 666 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.66 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  28.65 
 
 		 749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.97 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  26.75 
 
 		 740 aa  121  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.64 
 
 		 652 aa  120  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  29.08 
 
 		 672 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  27.57 
 
 		 659 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  31.01 
 
 		 658 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.38 
 
 		 712 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.85 
 
 		 1135 aa  118  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  30.48 
 
 		 336 aa  117  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  27.62 
 
 		 661 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  25.71 
 
 		 683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 514 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.84 
 
 		 657 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  28.84 
 
 		 655 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.84 
 
 		 657 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  24.86 
 
 		 716 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  27.93 
 
 		 778 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  28.84 
 
 		 655 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  28.84 
 
 		 657 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  28.84 
 
 		 655 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  28.84 
 
 		 655 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 659 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  27.5 
 
 		 737 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  28.7 
 
 		 664 aa  109  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.64 
 
 		 811 aa  109  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 421 aa  107  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.08 
 
 		 930 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.53 
 
 		 664 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  25.99 
 
 		 501 aa  106  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.71 
 
 		 702 aa  105  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.44 
 
 		 804 aa  104  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.15 
 
 		 544 aa  104  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.07 
 
 		 743 aa  104  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.75 
 
 		 810 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  29.53 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.54 
 
 		 773 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  28.29 
 
 		 899 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 508 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 773 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  27.64 
 
 		 869 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.72 
 
 		 741 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 857 aa  102  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  26.67 
 
 		 869 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.16 
 
 		 718 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.21 
 
 		 980 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 321 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.35 
 
 		 831 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>