60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3208 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  100 
 
 
540 aa  1068    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  41.67 
 
 
535 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  43.26 
 
 
536 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  44.1 
 
 
541 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  44.52 
 
 
532 aa  323  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  41.67 
 
 
558 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  42.86 
 
 
558 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  42.86 
 
 
538 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  43.58 
 
 
541 aa  317  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  41.21 
 
 
531 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  37.73 
 
 
638 aa  302  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  41.8 
 
 
522 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  51.53 
 
 
521 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  41.9 
 
 
525 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  54.35 
 
 
521 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  42.25 
 
 
494 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  48.91 
 
 
533 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  43.45 
 
 
650 aa  261  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  34.99 
 
 
529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 
899 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 
889 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  41.09 
 
 
919 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
895 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
885 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 
903 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  40.36 
 
 
889 aa  206  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  34.44 
 
 
869 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  36.8 
 
 
895 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  39.64 
 
 
863 aa  200  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
905 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
944 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
859 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 
917 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  37.82 
 
 
863 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 
844 aa  186  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
863 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
863 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
862 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
889 aa  173  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
868 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.97 
 
 
842 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
831 aa  163  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  32.58 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 
295 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  27.68 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  26.01 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  24.7 
 
 
555 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  25.8 
 
 
649 aa  77.4  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  25.48 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  25.94 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  23.51 
 
 
303 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  22.91 
 
 
369 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.95 
 
 
1290 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  23.48 
 
 
249 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  24.91 
 
 
555 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  25 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  23.13 
 
 
452 aa  53.9  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  25.47 
 
 
465 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  21.62 
 
 
620 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>