More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
868 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  76.95 
 
 
863 aa  1364    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  77.34 
 
 
862 aa  1361    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  76.65 
 
 
863 aa  1364    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.97 
 
 
842 aa  799    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  49.02 
 
 
831 aa  795    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  48.92 
 
 
903 aa  781    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  74.79 
 
 
885 aa  1322    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  43.88 
 
 
917 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  77.33 
 
 
863 aa  1345    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 
859 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  76.95 
 
 
863 aa  1363    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  100 
 
 
869 aa  1759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  40.63 
 
 
895 aa  598  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  39.72 
 
 
899 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
889 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 
889 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 
895 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 
944 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
919 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 
844 aa  548  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
889 aa  537  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  39.24 
 
 
905 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 
772 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  41.14 
 
 
541 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  42.04 
 
 
610 aa  227  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  41.74 
 
 
529 aa  226  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  40.12 
 
 
521 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  42.72 
 
 
525 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  42.72 
 
 
521 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  39.67 
 
 
531 aa  218  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  42 
 
 
522 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  39.94 
 
 
533 aa  214  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  36.06 
 
 
558 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  36.34 
 
 
558 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  36.14 
 
 
536 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  36.34 
 
 
650 aa  207  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  37.08 
 
 
532 aa  207  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  35.62 
 
 
638 aa  205  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  35.87 
 
 
535 aa  205  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  36.39 
 
 
541 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  36.97 
 
 
494 aa  202  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  33.33 
 
 
538 aa  197  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  39.31 
 
 
540 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
295 aa  155  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 
295 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  30.63 
 
 
652 aa  124  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.33 
 
 
652 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  30.38 
 
 
659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
658 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.91 
 
 
712 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  29.76 
 
 
749 aa  118  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  27.2 
 
 
501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.68 
 
 
810 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.48 
 
 
768 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.53 
 
 
672 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  26.41 
 
 
683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  30.1 
 
 
778 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.48 
 
 
652 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.19 
 
 
672 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  29.19 
 
 
672 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.31 
 
 
822 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  28.81 
 
 
666 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.62 
 
 
716 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.25 
 
 
546 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.57 
 
 
834 aa  111  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  28.65 
 
 
758 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.57 
 
 
831 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  28.69 
 
 
737 aa  110  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.72 
 
 
930 aa  110  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  29.34 
 
 
658 aa  109  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  27.74 
 
 
336 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 
321 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 
523 aa  108  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  27.08 
 
 
740 aa  107  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.57 
 
 
811 aa  107  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
494 aa  107  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  28.57 
 
 
661 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  28.61 
 
 
729 aa  106  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.9 
 
 
664 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
659 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
501 aa  105  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.43 
 
 
804 aa  104  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 
657 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 
657 aa  104  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  29.96 
 
 
655 aa  104  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
533 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
421 aa  103  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  29.96 
 
 
655 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  29.96 
 
 
657 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  29.96 
 
 
655 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  25.16 
 
 
564 aa  103  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.42 
 
 
794 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  29.96 
 
 
655 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
1231 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  28.77 
 
 
664 aa  101  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.87 
 
 
514 aa  101  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  29.08 
 
 
624 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  27.14 
 
 
555 aa  100  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>