More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1524 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  50.31 
 
 		 863 aa  811    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 842 aa  1738    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  50.74 
 
 		 863 aa  822    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  64.02 
 
 		 831 aa  1136    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  50.8 
 
 		 885 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  50.18 
 
 		 863 aa  809    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  50.18 
 
 		 862 aa  810    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  50.31 
 
 		 863 aa  812    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  48.97 
 
 		 869 aa  785    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  40.02 
 
 		 903 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 		 917 aa  585  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  37.03 
 
 		 868 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  35.01 
 
 		 859 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 889 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 889 aa  502  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 899 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  36.25 
 
 		 895 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 895 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 844 aa  481  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 905 aa  475  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 944 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 889 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 919 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 		 772 aa  251  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 610 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 529 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  35 
 
 		 541 aa  169  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  35 
 
 		 650 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  35.97 
 
 		 540 aa  163  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  35.14 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  33.11 
 
 		 538 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  33.1 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  32.38 
 
 		 494 aa  159  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  32.75 
 
 		 558 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  33.22 
 
 		 541 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  31.82 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  32.73 
 
 		 536 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  34.57 
 
 		 522 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  32.29 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  33.09 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  33.09 
 
 		 525 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 521 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  30.07 
 
 		 638 aa  147  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  32.36 
 
 		 531 aa  146  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.2 
 
 		 295 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.76 
 
 		 666 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  26.72 
 
 		 672 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.31 
 
 		 768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.72 
 
 		 672 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.47 
 
 		 672 aa  111  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  27.84 
 
 		 659 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.67 
 
 		 544 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.47 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  27.47 
 
 		 655 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.47 
 
 		 657 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 659 aa  108  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  27.47 
 
 		 655 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  27.47 
 
 		 655 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  27.47 
 
 		 655 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  27.47 
 
 		 657 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  27.41 
 
 		 683 aa  106  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  28.42 
 
 		 652 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  26.79 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.42 
 
 		 652 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  28.78 
 
 		 749 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 658 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 421 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.26 
 
 		 1135 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  25.92 
 
 		 661 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  25.08 
 
 		 716 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 514 aa  101  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  26.73 
 
 		 741 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  32.12 
 
 		 788 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.93 
 
 		 664 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  32.12 
 
 		 788 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  29.1 
 
 		 740 aa  99.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.06 
 
 		 652 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.62 
 
 		 810 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  28.89 
 
 		 788 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  29.84 
 
 		 778 aa  99  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  26.62 
 
 		 336 aa  97.8  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  27.53 
 
 		 658 aa  97.8  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.03 
 
 		 930 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  26.11 
 
 		 501 aa  96.3  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  26.99 
 
 		 555 aa  96.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  25.46 
 
 		 664 aa  95.9  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.25 
 
 		 503 aa  95.9  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.51 
 
 		 831 aa  94.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 321 aa  94.4  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.76 
 
 		 804 aa  94  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.42 
 
 		 773 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 773 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  27.11 
 
 		 758 aa  92.8  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.46 
 
 		 514 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  23.57 
 
 		 624 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  29.08 
 
 		 729 aa  91.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.18 
 
 		 834 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  27.2 
 
 		 737 aa  91.3  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>