More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1704 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
514 aa  1038    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  29.34 
 
 
501 aa  229  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.97 
 
 
503 aa  212  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
547 aa  206  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  30.31 
 
 
564 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
650 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.95 
 
 
544 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.74 
 
 
716 aa  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  29.05 
 
 
737 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  27.17 
 
 
707 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.93 
 
 
712 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.59 
 
 
586 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  26.21 
 
 
909 aa  136  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
591 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
772 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
1140 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
917 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  30 
 
 
658 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  29.08 
 
 
778 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  31.23 
 
 
726 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
1231 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  29.12 
 
 
652 aa  126  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.12 
 
 
652 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.12 
 
 
652 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  26.99 
 
 
788 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
1140 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
885 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  26.92 
 
 
863 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
857 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  27.6 
 
 
869 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
1140 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
863 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  26.64 
 
 
863 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  29.03 
 
 
666 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
862 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  26.77 
 
 
845 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.77 
 
 
980 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  24.35 
 
 
741 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.77 
 
 
514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  26.68 
 
 
845 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.87 
 
 
845 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
863 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.74 
 
 
696 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  28.05 
 
 
846 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  27.15 
 
 
845 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  27.15 
 
 
845 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
848 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
846 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
848 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  27.73 
 
 
788 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  27.21 
 
 
729 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
848 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  27.73 
 
 
788 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
1129 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.63 
 
 
702 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  25.41 
 
 
855 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  30.43 
 
 
758 aa  117  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  27.78 
 
 
848 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  29.63 
 
 
740 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
868 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
889 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
658 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.34 
 
 
822 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.14 
 
 
846 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28.52 
 
 
659 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
903 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.68 
 
 
845 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.71 
 
 
811 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  28.07 
 
 
661 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.53 
 
 
672 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  28.53 
 
 
672 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.58 
 
 
718 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
659 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
831 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.73 
 
 
794 aa  114  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.51 
 
 
768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.06 
 
 
730 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  28 
 
 
672 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.57 
 
 
730 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
919 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.96 
 
 
930 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.29 
 
 
845 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  27.95 
 
 
699 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.14 
 
 
1135 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.92 
 
 
851 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.87 
 
 
842 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.73 
 
 
810 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  27.24 
 
 
895 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.25 
 
 
831 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
895 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.84 
 
 
804 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.08 
 
 
834 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
859 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  27.24 
 
 
739 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.33 
 
 
749 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
899 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.09 
 
 
743 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
889 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
905 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>