More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0208 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 
564 aa  1155    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  57.93 
 
 
547 aa  667    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  38.03 
 
 
501 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.91 
 
 
503 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
514 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.84 
 
 
544 aa  174  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
620 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.28 
 
 
778 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 
650 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
591 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25.9 
 
 
737 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  29.26 
 
 
712 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.79 
 
 
586 aa  159  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.85 
 
 
980 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.88 
 
 
716 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  28.1 
 
 
869 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
857 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  26.89 
 
 
899 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.33 
 
 
768 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  26.6 
 
 
788 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  28.13 
 
 
869 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 
845 aa  144  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  26.26 
 
 
855 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  27.39 
 
 
658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  26.52 
 
 
899 aa  140  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.1 
 
 
702 aa  140  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  27.35 
 
 
869 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
1129 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.39 
 
 
696 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  27.59 
 
 
867 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  26.88 
 
 
846 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  26.88 
 
 
848 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
848 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  27.3 
 
 
665 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
846 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  27.04 
 
 
909 aa  137  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
848 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
848 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
1140 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.68 
 
 
930 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.95 
 
 
570 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  26.77 
 
 
788 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  26.77 
 
 
788 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  27.74 
 
 
874 aa  133  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
1140 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  27.74 
 
 
874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  27.74 
 
 
874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  27.74 
 
 
874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  27.74 
 
 
874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  26.97 
 
 
872 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 
1231 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  27.09 
 
 
872 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
1140 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  26.04 
 
 
699 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  27.09 
 
 
872 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.09 
 
 
872 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  27.09 
 
 
872 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  27.04 
 
 
845 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.06 
 
 
851 aa  131  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  27.04 
 
 
845 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  27.09 
 
 
872 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  27.09 
 
 
872 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  27.09 
 
 
872 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  27.04 
 
 
872 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.61 
 
 
811 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
772 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.61 
 
 
846 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  26.37 
 
 
739 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.45 
 
 
845 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  26.39 
 
 
845 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  27.1 
 
 
845 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.1 
 
 
845 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  28.33 
 
 
726 aa  127  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  26.87 
 
 
872 aa  127  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.75 
 
 
718 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  28.21 
 
 
741 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.34 
 
 
822 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.11 
 
 
831 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  24.75 
 
 
652 aa  124  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.75 
 
 
652 aa  124  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.92 
 
 
514 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.24 
 
 
672 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.95 
 
 
743 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  26.24 
 
 
672 aa  123  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.81 
 
 
652 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  25.69 
 
 
740 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  26.72 
 
 
661 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.04 
 
 
672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.41 
 
 
810 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.14 
 
 
730 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  27.46 
 
 
666 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.09 
 
 
804 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.54 
 
 
834 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.4 
 
 
734 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  25.5 
 
 
1455 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  26.4 
 
 
734 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  27.23 
 
 
683 aa  120  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  28.06 
 
 
729 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  26.88 
 
 
664 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
658 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>