More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  50.6 
 
 		 734 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  47.89 
 
 		 872 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  47.89 
 
 		 872 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  51.08 
 
 		 869 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  51.23 
 
 		 869 aa  651    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  51.49 
 
 		 869 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  47.89 
 
 		 872 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  49.78 
 
 		 739 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.77 
 
 		 848 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  47.89 
 
 		 872 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.77 
 
 		 846 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  52.29 
 
 		 845 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  52.58 
 
 		 845 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  48.03 
 
 		 872 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  47.74 
 
 		 872 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  47.89 
 
 		 872 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  54.62 
 
 		 846 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.77 
 
 		 848 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  49.62 
 
 		 734 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  47.6 
 
 		 872 aa  638    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  50.22 
 
 		 857 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  52.44 
 
 		 845 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  48.82 
 
 		 743 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.77 
 
 		 848 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  52.28 
 
 		 845 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  47.89 
 
 		 872 aa  646    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  58.17 
 
 		 702 aa  835    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  59.35 
 
 		 699 aa  840    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  52.44 
 
 		 845 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  100 
 
 		 1455 aa  2904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  52.29 
 
 		 845 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  53.77 
 
 		 846 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  60.91 
 
 		 696 aa  841    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  48.07 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  47.44 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  47.44 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  47.44 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  47.44 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.43 
 
 		 845 aa  635  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  47.44 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  53.59 
 
 		 848 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  48.04 
 
 		 872 aa  623  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  49.48 
 
 		 851 aa  624  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  45.05 
 
 		 899 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  47.61 
 
 		 867 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  47.63 
 
 		 899 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3939  cellulose synthase regulator protein  35.3 
 
 		 760 aa  420  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0298213 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  38.47 
 
 		 726 aa  389  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.59 
 
 		 804 aa  386  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  34.32 
 
 		 729 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4082  cellulose synthase regulator protein  34.66 
 
 		 846 aa  387  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.79 
 
 		 730 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.07 
 
 		 811 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3894  cellulose synthase regulator protein  33.83 
 
 		 849 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.7 
 
 		 730 aa  374  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.39 
 
 		 834 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.39 
 
 		 831 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  35.02 
 
 		 707 aa  370  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.39 
 
 		 822 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  38.65 
 
 		 758 aa  364  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  37.96 
 
 		 788 aa  363  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.1 
 
 		 794 aa  362  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  37.86 
 
 		 788 aa  362  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.23 
 
 		 930 aa  361  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  37.79 
 
 		 788 aa  360  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.57 
 
 		 810 aa  355  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  34.81 
 
 		 909 aa  354  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  37.42 
 
 		 778 aa  349  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  38.23 
 
 		 712 aa  320  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  35.44 
 
 		 773 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  35.07 
 
 		 781 aa  318  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  35.07 
 
 		 781 aa  318  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3527  cellulose synthase regulator protein  31.49 
 
 		 781 aa  316  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3255  cellulose synthase regulator protein  33.47 
 
 		 854 aa  315  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  33.81 
 
 		 737 aa  314  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  41.63 
 
 		 1140 aa  314  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  40.79 
 
 		 1129 aa  311  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  32.19 
 
 		 767 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  34.32 
 
 		 773 aa  302  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 1140 aa  302  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0075  cellulose synthase regulator protein  31.5 
 
 		 772 aa  301  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0072  cellulose synthase regulator protein  31.59 
 
 		 785 aa  300  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.47 
 
 		 718 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  35.96 
 
 		 771 aa  298  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  41.68 
 
 		 1140 aa  297  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2070  cellulose synthase regulator protein  34.39 
 
 		 762 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2137  cellulose synthase regulator protein  33.29 
 
 		 749 aa  296  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  35.28 
 
 		 771 aa  296  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2041  cellulose synthase regulator protein  33.01 
 
 		 847 aa  296  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970737  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  35.77 
 
 		 768 aa  295  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5837  cellulose synthase regulator protein  33.38 
 
 		 860 aa  295  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2636  cellulose synthase regulator protein  33.24 
 
 		 760 aa  294  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.462624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3196  cellulose synthase regulator protein  31.98 
 
 		 761 aa  294  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  35.81 
 
 		 764 aa  294  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  36.7 
 
 		 716 aa  290  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.75 
 
 		 768 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1028  cyclic di-GMP binding protein WssC, putative  32.5 
 
 		 751 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0149  cellulose synthase regulator protein  31.56 
 
 		 769 aa  284  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3934  cellulose synthase regulator protein  30.51 
 
 		 766 aa  283  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  34.18 
 
 		 798 aa  282  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>