51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0791 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  75 
 
 
781 aa  1064    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  75.64 
 
 
773 aa  1063    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  74.08 
 
 
764 aa  1014    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0685  cellulose synthase regulator protein  87.89 
 
 
815 aa  1287    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2146  cellulose synthase regulator protein  88.51 
 
 
815 aa  1299    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.564564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2232  cellulose synthase regulator protein  88.64 
 
 
815 aa  1300    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2007  cellulose synthase regulator protein  87.89 
 
 
815 aa  1287    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.834808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  75 
 
 
781 aa  1064    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  73.74 
 
 
771 aa  1018    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  54.42 
 
 
767 aa  746    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  100 
 
 
773 aa  1527    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  73.88 
 
 
771 aa  1035    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  88.51 
 
 
798 aa  1299    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3527  cellulose synthase regulator protein  52.35 
 
 
781 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1590  cellulose synthase regulator protein  87.89 
 
 
798 aa  1289    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  74.65 
 
 
768 aa  1023    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2070  cellulose synthase regulator protein  44.92 
 
 
762 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3255  cellulose synthase regulator protein  41.2 
 
 
854 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5837  cellulose synthase regulator protein  40.42 
 
 
860 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2041  cellulose synthase regulator protein  40.21 
 
 
847 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970737  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1028  cyclic di-GMP binding protein WssC, putative  40.59 
 
 
751 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0149  cellulose synthase regulator protein  36.24 
 
 
769 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2137  cellulose synthase regulator protein  35.81 
 
 
749 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0075  cellulose synthase regulator protein  34.23 
 
 
772 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0072  cellulose synthase regulator protein  34.48 
 
 
785 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03380  regulator of cellulose synthase, cyclic di-GMP binding  35.44 
 
 
779 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0185  cellulose synthase regulator protein  35.44 
 
 
769 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3841  cellulose synthase regulator protein  35.29 
 
 
769 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.811358 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03333  hypothetical protein  35.44 
 
 
779 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4020  cellulose synthase regulator protein  35.44 
 
 
779 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2636  cellulose synthase regulator protein  35.54 
 
 
760 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.462624  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0181  cellulose synthase subunit B  35.59 
 
 
767 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3934  cellulose synthase regulator protein  35.63 
 
 
766 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3994  cellulose synthase regulator protein  35.49 
 
 
766 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118962  normal  0.69945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3890  cellulose synthase regulator protein  35.58 
 
 
759 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3196  cellulose synthase regulator protein  35.11 
 
 
761 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3938  cellulose synthase regulator protein  35.29 
 
 
776 aa  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.047367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3813  cellulose synthase regulator protein  36.22 
 
 
766 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.343485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3826  cellulose synthase regulator protein  35.49 
 
 
759 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.732973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4897  cellulose synthase regulator protein  35.19 
 
 
791 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3929  cellulose synthase regulator protein  34.56 
 
 
810 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  34.91 
 
 
1455 aa  291  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3939  cellulose synthase regulator protein  27.42 
 
 
760 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0298213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3894  cellulose synthase regulator protein  28.43 
 
 
849 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4082  cellulose synthase regulator protein  26.8 
 
 
846 aa  219  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  23.78 
 
 
758 aa  80.9  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3769  hypothetical protein  26.1 
 
 
718 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.027232  unclonable  0.0000170961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1115  hypothetical protein  27.25 
 
 
713 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.732014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  31.4 
 
 
768 aa  57  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1829  cellulose synthase subunit B  27.44 
 
 
682 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  25 
 
 
766 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>