57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00788 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00788  celB protein  100 
 
 		 758 aa  1556    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  25.7 
 
 		 817 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  25.88 
 
 		 813 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  24.14 
 
 		 875 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  24.54 
 
 		 862 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  24.66 
 
 		 773 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  24.56 
 
 		 781 aa  90.9  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  24.56 
 
 		 781 aa  90.9  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3929  cellulose synthase regulator protein  22.44 
 
 		 810 aa  89  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  23.18 
 
 		 773 aa  87  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  23.6 
 
 		 771 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  23.04 
 
 		 768 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2232  cellulose synthase regulator protein  23.31 
 
 		 815 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  23.71 
 
 		 773 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  23.31 
 
 		 798 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2146  cellulose synthase regulator protein  23.31 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.564564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  24.83 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3938  cellulose synthase regulator protein  22.19 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.047367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  24.66 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4897  cellulose synthase regulator protein  22.02 
 
 		 791 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0185  cellulose synthase regulator protein  22.02 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4020  cellulose synthase regulator protein  21.73 
 
 		 779 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03380  regulator of cellulose synthase, cyclic di-GMP binding  22.02 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0181  cellulose synthase subunit B  22.02 
 
 		 767 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03333  hypothetical protein  22.02 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3841  cellulose synthase regulator protein  22.02 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.811358 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2007  cellulose synthase regulator protein  23.04 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.834808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1590  cellulose synthase regulator protein  23.04 
 
 		 798 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0685  cellulose synthase regulator protein  23.04 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  23.43 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  22.97 
 
 		 842 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  30.16 
 
 		 758 aa  74.3  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3890  cellulose synthase regulator protein  22.45 
 
 		 759 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3813  cellulose synthase regulator protein  22.45 
 
 		 766 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.343485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3934  cellulose synthase regulator protein  22.45 
 
 		 766 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3994  cellulose synthase regulator protein  22.45 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118962  normal  0.69945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3826  cellulose synthase regulator protein  22.28 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.732973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  25.35 
 
 		 858 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  35.85 
 
 		 768 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  27.38 
 
 		 881 aa  62  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  27.38 
 
 		 880 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  24.12 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0072  cellulose synthase regulator protein  22.06 
 
 		 785 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3196  cellulose synthase regulator protein  21.39 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2137  cellulose synthase regulator protein  21.75 
 
 		 749 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  25.48 
 
 		 725 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  25.48 
 
 		 725 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  24.14 
 
 		 721 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0149  cellulose synthase regulator protein  21.46 
 
 		 769 aa  52.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3527  cellulose synthase regulator protein  25.1 
 
 		 781 aa  51.6  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2636  cellulose synthase regulator protein  21.59 
 
 		 760 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.462624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  25.76 
 
 		 727 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2070  cellulose synthase regulator protein  23.11 
 
 		 762 aa  48.5  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3894  cellulose synthase regulator protein  21.18 
 
 		 849 aa  48.5  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3939  cellulose synthase regulator protein  20.7 
 
 		 760 aa  47.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0298213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0075  cellulose synthase regulator protein  21.62 
 
 		 772 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  25.66 
 
 		 766 aa  44.3  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>