29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0572 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1532    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  25.41 
 
 		 813 aa  81.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  24.2 
 
 		 773 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  23.67 
 
 		 817 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  35.85 
 
 		 758 aa  65.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  22.54 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  30 
 
 		 773 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  31.25 
 
 		 771 aa  54.7  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3255  cellulose synthase regulator protein  30.83 
 
 		 854 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  24.89 
 
 		 843 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  29.81 
 
 		 781 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  30.06 
 
 		 771 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  29.81 
 
 		 781 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  30.38 
 
 		 768 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0685  cellulose synthase regulator protein  32.03 
 
 		 815 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2146  cellulose synthase regulator protein  32.03 
 
 		 815 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.564564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2232  cellulose synthase regulator protein  32.03 
 
 		 815 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2007  cellulose synthase regulator protein  32.03 
 
 		 815 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.834808  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2041  cellulose synthase regulator protein  27.01 
 
 		 847 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970737  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  32.03 
 
 		 798 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1590  cellulose synthase regulator protein  32.03 
 
 		 798 aa  51.2  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5837  cellulose synthase regulator protein  27.5 
 
 		 860 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  28.83 
 
 		 767 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  30.43 
 
 		 764 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1028  cyclic di-GMP binding protein WssC, putative  27.46 
 
 		 751 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  29.5 
 
 		 773 aa  47.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3527  cellulose synthase regulator protein  28.99 
 
 		 781 aa  47.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0999  hypothetical protein  29.75 
 
 		 746 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3820  hypothetical protein  27.27 
 
 		 745 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.081896  hitchhiker  0.00152117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>