20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5209 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  47.43 
 
 		 817 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  47.61 
 
 		 813 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  100 
 
 		 773 aa  1555    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  38.25 
 
 		 758 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  27.58 
 
 		 858 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  29.06 
 
 		 766 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  30.49 
 
 		 875 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  32.04 
 
 		 880 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  31.75 
 
 		 862 aa  185  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  31.23 
 
 		 881 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  31.78 
 
 		 842 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  30.62 
 
 		 843 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  23.27 
 
 		 758 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  24.56 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  24.24 
 
 		 721 aa  51.2  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  25.34 
 
 		 725 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  25.34 
 
 		 725 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0072  cellulose synthase regulator protein  21.63 
 
 		 785 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 727 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  23.36 
 
 		 771 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>