25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1294 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  100 
 
 		 813 aa  1623    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  91.84 
 
 		 817 aa  1347    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  45.16 
 
 		 773 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  37.82 
 
 		 758 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  32.02 
 
 		 843 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  30.97 
 
 		 875 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  29.15 
 
 		 862 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  30.57 
 
 		 842 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  31.02 
 
 		 881 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 858 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  30.95 
 
 		 880 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  25.57 
 
 		 766 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  25.88 
 
 		 758 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  25.91 
 
 		 727 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  25.1 
 
 		 768 aa  73.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  35.29 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  25.32 
 
 		 781 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  25.32 
 
 		 781 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  25.32 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  23.26 
 
 		 767 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  23.88 
 
 		 771 aa  50.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  24.08 
 
 		 764 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  24.08 
 
 		 771 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  24.01 
 
 		 768 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  23.99 
 
 		 773 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>