29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4798 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  100 
 
 
766 aa  1439    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  36.41 
 
 
862 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  43.92 
 
 
858 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  42.61 
 
 
842 aa  353  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  40.91 
 
 
843 aa  342  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  41.4 
 
 
875 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  39.61 
 
 
881 aa  311  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  38.83 
 
 
880 aa  298  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  29.85 
 
 
773 aa  220  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  28.46 
 
 
758 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  27.56 
 
 
817 aa  207  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  25.94 
 
 
813 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  29.02 
 
 
721 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  27.74 
 
 
725 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  26.85 
 
 
725 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 
727 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  27.1 
 
 
773 aa  51.2  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  25.73 
 
 
758 aa  50.8  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  28.43 
 
 
798 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2146  cellulose synthase regulator protein  26.95 
 
 
815 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.564564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2232  cellulose synthase regulator protein  28.43 
 
 
815 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0685  cellulose synthase regulator protein  25.48 
 
 
815 aa  49.3  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2007  cellulose synthase regulator protein  25.48 
 
 
815 aa  49.3  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.834808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1590  cellulose synthase regulator protein  27.15 
 
 
798 aa  49.3  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1829  cellulose synthase subunit B  28.45 
 
 
682 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  25.77 
 
 
781 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  25.77 
 
 
781 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  25.19 
 
 
764 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  25.93 
 
 
768 aa  44.3  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>