28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1829 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1829  cellulose synthase subunit B  100 
 
 
682 aa  1334    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3769  hypothetical protein  43.58 
 
 
718 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.027232  unclonable  0.0000170961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1115  hypothetical protein  43.16 
 
 
713 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.732014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  27.26 
 
 
768 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  27.76 
 
 
798 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  28.11 
 
 
773 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2146  cellulose synthase regulator protein  27.76 
 
 
815 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.564564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2232  cellulose synthase regulator protein  27.76 
 
 
815 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1590  cellulose synthase regulator protein  27.55 
 
 
798 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  27.49 
 
 
771 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  28.92 
 
 
771 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0685  cellulose synthase regulator protein  27.55 
 
 
815 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  28.37 
 
 
764 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2007  cellulose synthase regulator protein  27.55 
 
 
815 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.834808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  28.13 
 
 
781 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  28.13 
 
 
781 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  26.33 
 
 
767 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3820  hypothetical protein  27.96 
 
 
745 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.081896  hitchhiker  0.00152117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0999  hypothetical protein  26.9 
 
 
746 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  25.75 
 
 
1455 aa  55.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  27.44 
 
 
773 aa  55.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3527  cellulose synthase regulator protein  25.46 
 
 
781 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1028  cyclic di-GMP binding protein WssC, putative  32.14 
 
 
751 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3585  hypothetical protein  25.95 
 
 
769 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.717748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2070  cellulose synthase regulator protein  32.28 
 
 
762 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5837  cellulose synthase regulator protein  31.98 
 
 
860 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  28.19 
 
 
766 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2041  cellulose synthase regulator protein  27.01 
 
 
847 aa  43.9  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970737  normal  0.231422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>