33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1115 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3769  hypothetical protein  72.31 
 
 		 718 aa  978    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.027232  unclonable  0.0000170961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1401    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.732014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1829  cellulose synthase subunit B  42.77 
 
 		 682 aa  465  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3820  hypothetical protein  32.16 
 
 		 745 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.081896  hitchhiker  0.00152117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0999  hypothetical protein  32 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  28.76 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  28.76 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  28.23 
 
 		 764 aa  72  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  27.32 
 
 		 768 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  27.99 
 
 		 798 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  28.02 
 
 		 771 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2146  cellulose synthase regulator protein  27.99 
 
 		 815 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.564564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  27.11 
 
 		 771 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  27.82 
 
 		 773 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2232  cellulose synthase regulator protein  27.99 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  27.52 
 
 		 773 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1590  cellulose synthase regulator protein  27.44 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0685  cellulose synthase regulator protein  27.44 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2007  cellulose synthase regulator protein  27.44 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.834808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  24.68 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2041  cellulose synthase regulator protein  31.25 
 
 		 847 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970737  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3527  cellulose synthase regulator protein  25.14 
 
 		 781 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3255  cellulose synthase regulator protein  33.33 
 
 		 854 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5837  cellulose synthase regulator protein  31.71 
 
 		 860 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3585  hypothetical protein  24.91 
 
 		 769 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.717748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  23.62 
 
 		 758 aa  47.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1028  cyclic di-GMP binding protein WssC, putative  23.5 
 
 		 751 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3939  cellulose synthase regulator protein  25.96 
 
 		 760 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0298213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3929  cellulose synthase regulator protein  26.92 
 
 		 810 aa  43.9  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2070  cellulose synthase regulator protein  29.56 
 
 		 762 aa  43.9  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029094 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3934  cellulose synthase regulator protein  28.57 
 
 		 766 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3813  cellulose synthase regulator protein  28.57 
 
 		 766 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.343485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3994  cellulose synthase regulator protein  28.57 
 
 		 766 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118962  normal  0.69945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>