48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3939 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3939  cellulose synthase regulator protein  100 
 
 
760 aa  1559    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0298213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4082  cellulose synthase regulator protein  56.5 
 
 
846 aa  873    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3894  cellulose synthase regulator protein  59.77 
 
 
849 aa  871    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  34.98 
 
 
1455 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3255  cellulose synthase regulator protein  28.04 
 
 
854 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3890  cellulose synthase regulator protein  28.01 
 
 
759 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0181  cellulose synthase subunit B  28.34 
 
 
767 aa  250  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3826  cellulose synthase regulator protein  28.15 
 
 
759 aa  250  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.732973  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3934  cellulose synthase regulator protein  28.01 
 
 
766 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03333  hypothetical protein  28.21 
 
 
779 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03380  regulator of cellulose synthase, cyclic di-GMP binding  28.21 
 
 
779 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3841  cellulose synthase regulator protein  27.91 
 
 
769 aa  249  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.811358 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0185  cellulose synthase regulator protein  28.21 
 
 
769 aa  249  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1379  cellulose synthase regulator protein  26.91 
 
 
781 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0897  cellulose synthase regulator protein  26.91 
 
 
781 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00746181  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3994  cellulose synthase regulator protein  27.88 
 
 
766 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118962  normal  0.69945 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4020  cellulose synthase regulator protein  28.21 
 
 
779 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3938  cellulose synthase regulator protein  27.99 
 
 
776 aa  247  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.047367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1357  cellulose synthase regulator protein  27.02 
 
 
773 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195811  normal  0.189415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3813  cellulose synthase regulator protein  27.88 
 
 
766 aa  245  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.343485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0075  cellulose synthase regulator protein  28.55 
 
 
772 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2250  cellulose synthase regulator protein  27.34 
 
 
767 aa  243  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.119222  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3527  cellulose synthase regulator protein  27.03 
 
 
781 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1926  cellulose synthase regulator protein  27.38 
 
 
768 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.90716  normal  0.0214112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4897  cellulose synthase regulator protein  27.74 
 
 
791 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5837  cellulose synthase regulator protein  27.58 
 
 
860 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3929  cellulose synthase regulator protein  27.24 
 
 
810 aa  239  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0072  cellulose synthase regulator protein  28.5 
 
 
785 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2041  cellulose synthase regulator protein  27.68 
 
 
847 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970737  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4525  cellulose synthase regulator protein  26.69 
 
 
771 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00483718  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1028  cyclic di-GMP binding protein WssC, putative  26.25 
 
 
751 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0791  cellulose synthase regulator protein  27.07 
 
 
773 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115252  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1291  cellulose synthase regulator protein  27.06 
 
 
764 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371129  normal  0.0459836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2137  cellulose synthase regulator protein  26.9 
 
 
749 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1258  cellulose synthase regulator protein  27.04 
 
 
771 aa  232  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0149  cellulose synthase regulator protein  29.3 
 
 
769 aa  230  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2636  cellulose synthase regulator protein  26.63 
 
 
760 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.462624  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0633  cellulose synthase regulator protein  26.79 
 
 
798 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2146  cellulose synthase regulator protein  26.79 
 
 
815 aa  224  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.564564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2232  cellulose synthase regulator protein  26.79 
 
 
815 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2007  cellulose synthase regulator protein  26.11 
 
 
815 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.834808  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0685  cellulose synthase regulator protein  26.11 
 
 
815 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1590  cellulose synthase regulator protein  26.11 
 
 
798 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3196  cellulose synthase regulator protein  26.89 
 
 
761 aa  217  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2070  cellulose synthase regulator protein  25.85 
 
 
762 aa  210  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  20.7 
 
 
758 aa  47.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3769  hypothetical protein  25.96 
 
 
718 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.027232  unclonable  0.0000170961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1115  hypothetical protein  25.27 
 
 
713 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.732014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>