More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0076 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.43 
 
 		 848 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  67.81 
 
 		 872 aa  1255    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  67.81 
 
 		 872 aa  1255    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  58.21 
 
 		 869 aa  990    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  54.95 
 
 		 872 aa  968    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  53.68 
 
 		 739 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  68.89 
 
 		 874 aa  1222    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  55.23 
 
 		 845 aa  787    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  68.89 
 
 		 874 aa  1221    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.43 
 
 		 848 aa  779    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  57.73 
 
 		 869 aa  980    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  56.68 
 
 		 855 aa  824    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  67.81 
 
 		 872 aa  1255    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.39 
 
 		 846 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  68.89 
 
 		 874 aa  1220    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  57.06 
 
 		 845 aa  802    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  75.95 
 
 		 867 aa  1373    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  67.81 
 
 		 872 aa  1255    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  56.15 
 
 		 734 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  67.81 
 
 		 872 aa  1255    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  57.72 
 
 		 743 aa  820    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.52 
 
 		 845 aa  794    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  67.7 
 
 		 872 aa  1251    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  100 
 
 		 899 aa  1853    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  56.29 
 
 		 846 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  68.89 
 
 		 874 aa  1219    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  56.3 
 
 		 734 aa  800    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  67.81 
 
 		 872 aa  1256    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  93.44 
 
 		 899 aa  1709    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  68.48 
 
 		 874 aa  1220    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  57.48 
 
 		 857 aa  826    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  66.74 
 
 		 872 aa  1233    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  54.57 
 
 		 845 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  55.39 
 
 		 846 aa  780    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  55.22 
 
 		 848 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  54.36 
 
 		 845 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  54.48 
 
 		 845 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  58.8 
 
 		 869 aa  1002    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  54.57 
 
 		 845 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  67.24 
 
 		 872 aa  1241    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.43 
 
 		 848 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  52.35 
 
 		 851 aa  715    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  47.95 
 
 		 702 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  46.97 
 
 		 696 aa  621  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  46.39 
 
 		 699 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  47.6 
 
 		 1455 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.68 
 
 		 831 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.05 
 
 		 804 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.49 
 
 		 834 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.71 
 
 		 794 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.68 
 
 		 822 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  37.03 
 
 		 758 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  37.95 
 
 		 707 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.73 
 
 		 930 aa  369  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  33.24 
 
 		 729 aa  366  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  35.59 
 
 		 726 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36 
 
 		 730 aa  360  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  36.33 
 
 		 909 aa  359  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.69 
 
 		 810 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.1 
 
 		 730 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  38.19 
 
 		 778 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.57 
 
 		 811 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  36.67 
 
 		 788 aa  353  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  36.2 
 
 		 788 aa  353  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  37.27 
 
 		 788 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  33.96 
 
 		 737 aa  326  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  36.17 
 
 		 712 aa  300  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  32.6 
 
 		 741 aa  290  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 		 1140 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 1129 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  39.86 
 
 		 1140 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.53 
 
 		 768 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  39.35 
 
 		 1140 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.62 
 
 		 718 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  35.77 
 
 		 716 aa  272  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  31.61 
 
 		 749 aa  268  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  33.6 
 
 		 661 aa  255  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  35.36 
 
 		 664 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  32.57 
 
 		 672 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.13 
 
 		 672 aa  253  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  40.17 
 
 		 664 aa  252  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.51 
 
 		 672 aa  251  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.55 
 
 		 773 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  28.83 
 
 		 740 aa  245  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 773 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  35.38 
 
 		 666 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  30.28 
 
 		 683 aa  238  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 658 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.5 
 
 		 657 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.5 
 
 		 657 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  30.5 
 
 		 655 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  30.5 
 
 		 655 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  30.5 
 
 		 655 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  30.5 
 
 		 657 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  30.5 
 
 		 655 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.62 
 
 		 652 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.23 
 
 		 652 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28.19 
 
 		 659 aa  199  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  28.6 
 
 		 652 aa  198  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  28.26 
 
 		 658 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>