More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1367 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  98.68 
 
 		 834 aa  1670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  61.26 
 
 		 811 aa  929    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  100 
 
 		 831 aa  1691    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  48.44 
 
 		 729 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  61.01 
 
 		 804 aa  964    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  62.1 
 
 		 930 aa  862    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  48.4 
 
 		 730 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  91.48 
 
 		 822 aa  1432    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  74.61 
 
 		 794 aa  1185    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  48.51 
 
 		 726 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  72.68 
 
 		 810 aa  1161    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  47.7 
 
 		 730 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  48 
 
 		 788 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  48 
 
 		 788 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  47.34 
 
 		 788 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  44.19 
 
 		 778 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  45.44 
 
 		 707 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  44.19 
 
 		 758 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  38.32 
 
 		 872 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.32 
 
 		 872 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  36.03 
 
 		 909 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  38.27 
 
 		 872 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  38.32 
 
 		 872 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  38.32 
 
 		 872 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  38.32 
 
 		 872 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  38.5 
 
 		 872 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  37.92 
 
 		 872 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  38.32 
 
 		 872 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  38.46 
 
 		 874 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  38.46 
 
 		 874 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  38.46 
 
 		 874 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  38.29 
 
 		 874 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  38.46 
 
 		 874 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  37.12 
 
 		 855 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 		 857 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.34 
 
 		 702 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  38.02 
 
 		 869 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  38.2 
 
 		 869 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  38.02 
 
 		 869 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  37.77 
 
 		 899 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  39.88 
 
 		 845 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.5 
 
 		 696 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.12 
 
 		 845 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.87 
 
 		 851 aa  379  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  38.52 
 
 		 899 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.58 
 
 		 846 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  39.92 
 
 		 845 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  40.5 
 
 		 845 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  40.5 
 
 		 845 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  34.76 
 
 		 739 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.23 
 
 		 845 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.79 
 
 		 848 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  37.59 
 
 		 867 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.18 
 
 		 846 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.79 
 
 		 848 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.82 
 
 		 845 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  37.18 
 
 		 846 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.73 
 
 		 734 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.79 
 
 		 848 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  33.43 
 
 		 734 aa  365  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  34.4 
 
 		 699 aa  365  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.95 
 
 		 743 aa  365  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  36.91 
 
 		 848 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  34.5 
 
 		 872 aa  358  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  38.17 
 
 		 1455 aa  344  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  31.56 
 
 		 741 aa  280  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 1129 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  33.64 
 
 		 737 aa  260  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 1140 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.27 
 
 		 768 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  39.12 
 
 		 1140 aa  257  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 1140 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  33.59 
 
 		 712 aa  250  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.47 
 
 		 664 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  32.03 
 
 		 664 aa  242  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  34.78 
 
 		 716 aa  240  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  29 
 
 		 672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.3 
 
 		 718 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  33.26 
 
 		 749 aa  235  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  31.69 
 
 		 666 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.48 
 
 		 672 aa  234  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.11 
 
 		 672 aa  233  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 658 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  30.43 
 
 		 661 aa  227  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.7 
 
 		 1135 aa  220  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  29.4 
 
 		 658 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.06 
 
 		 773 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 773 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 659 aa  212  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  30.81 
 
 		 683 aa  211  5e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  29.65 
 
 		 659 aa  210  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.3 
 
 		 657 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  29.3 
 
 		 655 aa  207  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.3 
 
 		 657 aa  207  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  29.3 
 
 		 655 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  29.3 
 
 		 655 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  29.3 
 
 		 655 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  29.3 
 
 		 657 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  28.39 
 
 		 652 aa  203  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.07 
 
 		 652 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>